Dit is de Windows-app genaamd Molecular Dynamics Studio waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als WindowsRelease.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam Molecular Dynamics Studio gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start een OS OnWorks online emulator vanaf deze website, maar een betere Windows online emulator.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Windows-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie en installeer deze.
- 7. Download Wine van de softwarebronnen voor Linux-distributies. Eenmaal geïnstalleerd, kunt u vervolgens dubbelklikken op de app om ze met Wine uit te voeren. Je kunt ook PlayOnLinux proberen, een mooie interface via Wine waarmee je populaire Windows-programma's en -games kunt installeren.
Wine is een manier om Windows-software op Linux uit te voeren, maar zonder dat Windows vereist is. Wine is een open-source Windows-compatibiliteitslaag die Windows-programma's rechtstreeks op elke Linux-desktop kan uitvoeren. In wezen probeert Wine genoeg van Windows opnieuw te implementeren, zodat het al die Windows-applicaties kan draaien zonder Windows echt nodig te hebben.
SCREENSHOTS
Ad
Moleculaire Dynamica Studio
PRODUCTBESCHRIJVING
Dit is een verzameling softwareaanpassingen die zijn gemaakt om NanoEngineer-1, PACKMOL en MSI2LMP te integreren met als doel het eenvoudig maken van moleculaire dynamische cellen. NanoEngineer-1 is moleculaire CAD-software geschreven door Nanorex en biedt de gebruiker een gemakkelijke manier om moleculen te maken, terwijl de softwareaanpassingen de gebruiker in staat stellen atomen te typen met behulp van meerdere krachtvelden. PACKMOL kan een willekeurige verzameling moleculen genereren met behulp van de molecuultemplates van NanoEngineer-1 en zo de initiële MD-cel verschaffen. Door aanpassingen aan PACKMOL kunnen de gegevens van het atoomtype worden doorgegeven aan de MSI2LMP-software. MSI2LMP maakt een LAMMPS-invoerbestand op basis van klasse I of klasse II krachtvelden. MSI2LMP is aangepast om numeriek gecodeerde krachtveldgegevens te gebruiken die zijn gegenereerd door NanoEngineer-1. Het MMP-bestandsformaat werd uitgebreid en geïntegreerd in alle drie de softwaretoepassingen.http://www.nanoengineer-1.net
http://www.ime.unicamp.br/~martinez/packmol/
http://lammps.sandia.gov/
Voordelen
- Moleculaire CAD-mogelijkheden via NanoEngineer-1
- Typ handmatig atomen op basis van het CFF91 Atomistisch krachtveld
- Maak molecuulsjablonen met NanoEngineer-1
- Genereer een MD-cel met behulp van PACKMOL en sjablonen voor meerdere moleculen
- Genereer een LAMMPS Geometry Input File met MSI2LMP
Toehoorders
Science / Research
Gebruikersinterface
OpenGL, Qt
Programmeertaal
Fortran, Python, C++, C
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/moleculardynami/. Het is gehost in OnWorks om op een gemakkelijkste manier online te kunnen worden uitgevoerd vanuit een van onze gratis besturingssystemen.
