altree-convertp - Online w chmurze

PROGRAM:

IMIĘ

Altree-convert - Tytuł...

STRESZCZENIE

konwersja altree [opcje]

Opcje:
--version Wersja programu
--short-help|h krótka wiadomość pomocy
--help Komunikat pomocy z opisami opcji
--mężczyzna pełna dokumentacja
--pierwszy-plik-wejściowy|i plik wejściowy 1
--drugi-plik-wejściowy|j plik wejściowy 2 (nieobowiązkowy)
--plik-wyjściowy|o plik wyjściowy
--case-control-output|c wyjście zawierające nb przypadków/kontrolek
--typ-danych|t DNA|LICZ
--phylo-prog|p PAUP|PHYLIP
--reconstruct-prog|r FAZA|FAMHAP
--data-quali|q Rodzaj danych: jakościowy lub ilościowy
--nbind-threshold|s Minimalna liczba osobników wymagana do utrzymania haplotypu

OPCJE

--wersja
Wydrukuj wersję programu i wyjdzie.

--krótka pomoc
Wydrukuj krótki komunikat pomocy i wyjdź.

--help Wydrukuj wiadomość pomocy zawierającą opisy opcji i wyjścia.

--facet Drukuje stronę podręcznika i wychodzi.

--pierwszy-plik-wejściowy|i
Plik wejściowy 1 (wyjście programu rekonstrukcji haplotypu)

--drugi-plik-wejściowy|j
Plik wejściowy 2 (drugi wynik famhap lub plik zawierający stan chorobowy)

--plik-wyjściowy|o
Plik wyjściowy

--wyjście-kontrolne-przypadku|c
Plik wyjściowy zawierający liczbę przypadków i kontroli niosących każdy haplotyp

--typ-danych|t "DNA"|"SN"
Typ danych: DNA (ATGCU) lub SNP (0-1)

--phylo-prog|str "Filip" | "Paup"
Program rekonstrukcji filogenezy

rekonstrukcja-prog|r „famhap|faza”
Program rekonstrukcji haplotypów

jakość danych|q „jakościowe|ilościowe”
Rodzaj analizowanych danych

próg nbind|s
Minimalna liczba osobników posiadających haplotyp wymagana do przechowywania go
Dalsza analiza. Jeśli chcesz zachować wszystkie haplotypy, musisz wpłynąć na 0
zmienna

OPIS

To zdjęcie program odczyta podane pliki wejściowe i wygeneruje plik wejściowy dla
oprogramowanie do rekonstrukcji filogenetycznej paup lub phylip/paml

Użyj Altree-convertp online, korzystając z usług onworks.net