To jest polecenie asn2ff, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online systemu MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
asn2ff - konwertuj dane biologiczne ASN.1 do formatu płaskiego (stara wersja)
STRESZCZENIE
asn2ff [-] [-A X] [-B X] [-C] [-G] [-L F] [-M] [-R] [-V F] [-a filename] [-b] [-d] [-e]
[-f b/p/e/s/x/z] [-g] [-h F] [-k F] [-l filename] [-m r/d/s/c/k/l/e/p] [-n F]
[-o filename] [-p F] [-q] [-r filename] [-s] [-t] [-v F] [-w] [-y] [-z]
OPIS
asn2ff konwertuje opisy sekwencji biologicznych z formatu ASN.1 NCBI do jednego z
kilka formatów plików płaskich. Ten program jest zbudowany w oparciu o przestarzały interfejs; Proszę
posługiwać się asn2gb(1) zamiast.
OPCJE
Podsumowanie opcji znajduje się poniżej.
- Wydrukuj wiadomość o użyciu
-A X Pokaż region zaczynający się od X (domyślnie 0)
-B X Pokaż region kończący się na X (domyślnie jest to ostatnia pozycja)
-C Pokaż komentarze Bankita
-G Dane wyjściowe to jeden najwyższy bioseq tylko w widoku genomu
-L F Użyj starego formatu linii LOCUS (wcześniejszego niż Genbank 127.0).
-M Dane wyjściowe to tylko bioseq mapy
-R Do wydania GenBank
-V F Nie używaj WERSJI
-a filename
Nazwa pliku dla wejścia ASN.1 (domyślnie jest to stdin)
-b Wprowadź plik asn w trybie binarnym
-d Użyj indeksowania SeqMgr
-e Dane wejściowe są wpisami sekwencyjnymi
-f b/p/e/s/x/z
Format wyjściowy:
b GenBank (domyślnie)
p GenPept
e EMBL
PseudoEMBL
x GenBankWybierz
z EMBLPEPT
-g Pokaż liczby gi
-h F Ukryj sekwencję
-k F Nie używaj zestawów złożonych (phy-set, mut-set, pop-set)
-l filename
Loguj błędy do filename
-m r/d/s/c/k/l/e/p
Tryb wyjściowy:
r wydanie (domyślne)
zrzut
Cekiny
c Chromoskop
k dir-sub-debug
l dir-sub
poprawię
raport częściowy
-n F Ścisłe wiązanie genów
-o filename
Nazwa pliku wyjściowego (domyślnie jest to stdout)
-p F Pomiń nowe cechy genów
-q Dane wyjściowe to tylko jeden górny bioseq
-r filename
Wyjściowy plik dziennika błędów (domyślnie jest to stderr)
-s Dane wejściowe to przesłanie sekwencji
-t Pokaż szczegółowy tekst wiadomości
-v F Pomiń komunikaty o błędach
-w Użyj formatu wyjściowego HTML
-y Drukuj tylko format pomocy
-z Nowy algorytm dla organów
Użyj asn2ff online, korzystając z usług onworks.net
