Jest to polecenie bowtie2-inspect, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu darmowych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows lub emulator online MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
bowtie2-inspect - opakowanie na bowtie2-inspect-* index
STRESZCZENIE
bowtie2-inspekcja [Opcje]*
OPIS
Bowtie 2 wersja 2.2.6 autorstwa Bena Langmeada ([email chroniony], www.cs.jhu.edu/~langmea)
nazwa pliku bt2 minus końcowe .1.bt2/.2.bt2
Domyślnie drukuje rekordy FASTA indeksowanych sekwencji nukleotydowych do standardu
na zewnątrz. Z -n, drukuje tylko nazwy. Z -s, po prostu drukuje podsumowanie indeksu
parametry i sekwencje. Z -e, w stosownych przypadkach zachowuje kolory.
OPCJE
--duży-indeks
wymusza kontrolę „dużego” indeksu, nawet jeśli obecny jest „mały”.
-a/--przez
Liczba znaków w poprzek na wyjściu FASTA (domyślnie: 60)
-n/--nazwy
Wydrukuj tylko nazwy sekwencji referencyjnych
-s/--streszczenie
Wydrukuj podsumowanie, w tym nazwy odnośników, długości, właściwości indeksu
-e/--bt2-ref
Zrekonstruuj referencję z .bt2 (powoli, zachowuje kolory)
-v/--gadatliwy
Szczegółowe dane wyjściowe (do debugowania)
-h/--Wsparcie
wydrukuj szczegółowy opis narzędzia i jego opcji
--help wydrukuj tę wiadomość o użytkowaniu
Korzystaj z usługi bowtie2-inspect online, korzystając z usług onworks.net
