Jest to polecenie bp_nrdbp, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online systemu MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
bp_nrdb.PLS - skrypt emulujący nrdb Warrena Gisha, tworzący unikalną bazę danych sekwencji
zestaw wejściowych baz danych
STRESZCZENIE
Stosowanie:
bp_nrdb.PLS [opcje] plik1 plik2 plik3
Alternatywne zastosowanie
bp_nrdb.PLS -p [opcje] plik1 id1 plik2 id2 plik3 id3
OPIS
Skrypt ten utworzy unikalną bazę danych sekwencji (quasi-nieredundantną). Opcje
należą:
-o nazwa pliku - nazwa pliku, w którym zapisana jest baza danych (domyślnie STDOUT)
-a nazwa pliku - nazwa pliku, do którego ma zostać dołączona baza danych
-l# - minimalna wymagana długość sekwencji
-i - nie sprawdzaj duplikatów
-n# - maksymalna liczba opisów do raportu na sekwencję
-d# - ogranicznik używany pomiędzy kolejnymi opisami
-p - użyj przedrostków identyfikatora bazy danych z wiersza poleceń
Korzystaj z bp_nrdbp online, korzystając z usług onworks.net
