Jest to polecenie cmtk-interleaved_bad_slices, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online systemu MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
interleaved_bad_slices — Znajdź nieprawidłowe wycinki w szeregu czasowym przeplatanych obrazów (np.
seria fMRI w stanie spoczynku).
STRESZCZENIE
przeplatane_złe_plasterki Ścieżki obrazu
OPIS
To narzędzie odczytuje szeregi czasowe obrazów 3D i wykrywa wartości odstające.
OPCJE
Globalny Toolkit Opcje (te jest shared by cała kolekcja CMTK narzędzia)
--help
Zapisz listę podstawowych opcji wiersza poleceń na standardowe wyjście.
--Pomóż wszystkim
Napisz pełną listę podstawowych i zaawansowanych opcji wiersza poleceń na standardowe wyjście.
--wiki
Zapisz listę opcji wiersza poleceń na standardowe wyjście w znacznikach MediaWiki.
--facet
Zapisz źródło strony podręcznika w znaczniku 'nroff' na standardowe wyjście.
--wersja
Zapisz wersję zestawu narzędzi na standardowe wyjście.
--Echo
Zapisz bieżącą linię poleceń na standardowe wyjście.
--pełny-poziom
Ustaw poziom szczegółowości.
--gadatliwy, -v
Zwiększ poziom szczegółowości o 1 (przestarzałe; obsługiwane w celu zapewnienia zgodności z poprzednimi wersjami).
--wątki
Ustaw maksymalną liczbę równoległych wątków (dla wątków POSIX i OpenMP).
Wkład Opcje
--orientacja na plasterki
Zdefiniuj orientację plasterka obrazów dyfuzji. Obsługiwane wartości: „osiowe”,
„strzałkowy”, „koronowy”, „slice-x”, „slice-y”, „slice-z”, gdzie domyślnie jest „osiowy”,
lub użyj jednego z poniższych:
--osiowy
Plastry osiowe [To is dotychczasowy domyślny]
--strzałkowy
Plastry strzałkowe
--koronalny
Plastry koronalne
--wycinek-x
Oś współrzędnych X to kierunek wycinka
--plaster-y
Oś współrzędnych Y to kierunek wycinka
--wycinek-z
Oś współrzędnych Z to kierunek wycinka [To is dotychczasowy domyślny]
basen Plaster Wykrywanie
--metryczny
Metryka podobieństwa obrazu do obrazu służąca do porównywania sąsiednich plasterków. Obsługiwane wartości:
„ncc”, „rms”, gdzie wartością domyślną jest „ncc”, lub użyj jednego z poniższych:
--ncc
Znormalizowana korelacja krzyżowa. [To is dotychczasowy domyślny]
--RMS
Pierwiastek różnic średniokwadratowych.
--stdev-thresh
Próg dla identyfikacji złego wycinka w jednostkach intensywności odchylenia standardowe powyżej
wszystkie odpowiadające wycinki z pozostałych obrazów dyfuzji. [Domyślny: 3]
Wydajność Opcje
--bad-plasterki-thresh
Minimalna liczba wykrytych uszkodzonych wycinków przed zgłoszeniem wolumenu (tylko liczba
w tym przypadku zgłaszane są wykryte złe plasterki, a nie każdy plasterek osobno).
[Domyślny: 0]
AUTORSKI
Torsten Rohlfing, z udziałem Michaela P. Hasaka, Grega Jefferisa, Calvina R.
Maurer, Daniel B. Russakoff i Jarosław Halchenko
Użyj cmtk-interleaved_bad_slices online, korzystając z usług onworks.net
