Jest to polecenie fastq_quality_filter, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu darmowych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows lub emulator online MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
fastq_quality_filter — filtruje sekwencje na podstawie jakości
OPIS
użycie: fastq_quality_filter [-h] [-v] [-q N] [-p N] [-z] [-i INFILE] [-o OUTFILE] Część
Zestaw narzędzi FASTX 0.0.14 autorstwa A. Gordona ([email chroniony])
[-h] = Ten pomocny ekran pomocy.
[-q N] = Minimalny wynik jakości do zachowania.
[-p N] = Minimalny procent zasad, które muszą mieć jakość [-q].
[-z] = Skompresuj dane wyjściowe za pomocą GZIP.
[-i PLIK]
= plik wejściowy FASTA/Q. domyślnie jest to STDIN.
[-o OUTFILE] = plik wyjściowy FASTA/Q. domyślnie jest STDOUT. [-v] = Pełne -
zgłoś liczbę sekwencji.
Jeśli określono [-o],
raport zostanie wydrukowany na STDOUT.
Jeśli [-o] nie jest określone (a wyjście trafia do STDOUT), raport zostanie wydrukowany do
STDERR.
Użyj fastq_quality_filter online za pomocą usług onworks.net