gdcm2vtk — Online w chmurze

PROGRAM:

IMIĘ

gdcm2vtk - Konwertuje plik obsługiwany przez VTK na DICOM.

STRESZCZENIE

gdcm2vtk [opcje] wejście pliku-wyjście

OPIS

Połączenia gdcm2vtk pobiera jako dane wejściowe dowolny plik obsługiwany przez VTK (w tym plik DICOM) i będzie
wygeneruj jako wynik plik DICOM.

PARAMETRY

nazwa pliku wejściowego pliku wejściowego (obsługiwana DICOM lub VTK)

nazwa pliku wyjściowego pliku wyjściowego (obsługiwana DICOM lub VTK)

OPCJE

specyficzny Opcje
--force-rescale wymuszenie przeskalowania.
--rozmieszczenie sił, rozmieszczenie sił.
--palette-color, jeśli jest obsługiwany, generuje plik PALETTE COLOR.
--argb, jeśli jest obsługiwany, generuje plik ARGB.
--compress, jeśli jest obsługiwany, generuje skompresowany plik.
--use-vtkdicom Użyj vtkDICOMImageReader (zamiast GDCM).
--modalność ustawia modalność.
--dolny-lewy zestaw dolny lewy.
--shift ustawia przesunięcie.
--scale ustawia skalę.
--compress ustawia kompresję (MetaIO).
-T --study-uid UID badania.
-S --series-uid UID serii.
--root-uid Główny identyfikator użytkownika.

kompresja Opcje
-J --jpeg Kompresuj obraz w formacie jpeg.
-K --j2k Kompresuj obraz w j2k.
-L --jpegls Kompresuj obraz w jpeg-ls.
-R --rle Kompresuj obraz w rle (tylko bezstratne).

ogólny Opcje
-h --pomoc
wydrukuj ten tekst pomocy i wyjdź

-v --wersja
wydrukuj informacje o wersji i wyjdź

-V --pełne
tryb szczegółowy (ostrzeżenie+błąd).

-W --ostrzeżenie
tryb ostrzegawczy, drukuj informacje ostrzegawcze

-E --błąd
tryb błędu, drukowanie informacji o błędzie

-D --debuguj
tryb debugowania, drukuj informacje debugowania

środowisko zmienna
GDCM_ROOT_UID Główny identyfikator użytkownika

OPIS

Konwertuj plik obsługiwany przez VTK na DICOM.

Typowe zastosowanie to:

$ gdcm2vtkplik wejściowywyjście.dcm

Wykorzystuje wewnętrzny, fabryczny mechanizm VTK do rozpoznawania pliku (funkcja CanRead). Widzieć
Plik obsługiwany przez VTK tutaj:

Jakie formaty plików obrazów może czytać i zapisywać VTK? http://www.vtk.org/Wiki/VTK_FAQ#What_image_file_formats_can_VTK_read_and_write.3F

Jeśli plik wejściowy zawiera 4 komponenty, czwarta kompilacja (alfa) zostanie usunięta z pliku wyjściowego
plik, ponieważ DICOM nie obsługuje już komponentu alfa (patrz opcja –argb).

Szczególną uwagę zwrócono na następujący format pliku:

1. DICOM: Cosinusy kierunku i vtkMedicalImageInformation są przekazywane na wyjście
2. BMP: Plik można zapisać z tabelą przeglądową (zobacz --palette-color)
3. GE Signa: vtkMedicalImageProperties jest przekazywany na wyjście
4. MINC: Cosinus kierunku jest przekazywany na wyjście
5. TIFF: vtkTIFFReader jest obecnie w złym stanie w VTK (inne zachowanie w VTK 5.2 i git/master). Używaj go tylko, jeśli wiesz, co robisz.

KONWERTOWAĆ MetaObraz (mhd, mma)
$ gdcm2vtkplik wejściowywyjście.mha

To polecenie przekonwertuje wejściowy plik DICOM: plik wejściowy na plik MetaImage .mha. To samo
dotyczy pliku .mhd.

KONWERTOWAĆ MHA/MHD
$ gdcm2vtkplik wejściowywyjście.mha

or

$ gdcm2vtkplik wejściowywyjście.mhd

To polecenie przekonwertuje wejściowy plik DICOM: plik wejściowy na plik MetaImageData .mha/.mhd
plik.

KONWERTOWAĆ Vti
$ gdcm2vtkplik wejściowywyjście.vti

To polecenie przekonwertuje wejściowy plik DICOM: plik wejściowy na plik XML VTK ImageData .vti
plik.

KONWERTOWAĆ VTK
$ gdcm2vtkplik wejściowywyjście.vtk

To polecenie przekonwertuje wejściowy plik DICOM: plik wejściowy na starą strukturę VTK
Plik .vtk zestawu punktów.

KONWERTOWAĆ DICOM

$ gdcm2vtk wejście.dcm wyjście.dcm

vtkGDCMImageReader będzie używany do odczytu pliku DICOM, a nie domyślny
vtkDICOMImageReader. Zobacz opcję –use-vtkdicom, aby użyć vtkDICOMImageReader.

PODRÓŻ W OBIE STRONY DICOM DO MHD DO DICOM

$ gdcm2vtk wejście_ybr.dcm wyjście.mhd
$ gdcm2vtk --modalność US --imageformat 7 output.mhd output.dcm

Powyższa sekcja pokazuje, jak przekonwertować DICOM przy użyciu interpretacji fotometrycznej
YBR_FULL (lub nawet YBR_FULL_422 jest stratny) do innego formatu pliku: MetaImage (mhd). Od
ten format pliku nie obsługuje przestrzeni kolorów, musimy ją jawnie ustawić za pomocą
– opcja wiersza poleceń –imageformat. W tym przypadku wymagana jest opcja wiersza poleceń –modality
przypadek, ponieważ domyślna rodzina klas przechowywania dodatkowych obrazów przechwytujących nie pozwala na YBR
Interpretacja fotometryczna.

GDCM2VTK UWAGI

WAŻNA UWAGA: Wewnętrzna struktura VTK zostanie wypełniona z wejścia DICOM, a następnie
przekazać do wyjściowego modułu zapisującego DICOM. Niektóre informacje mogą zostać utracone podczas konwersji
DICOM do VTK do DICOM. Ta opcja jest najczęściej używana do testowania
Kombinacja vtkGDCMImageReader/vtkGDCMImageWriter.

WAŻNA UWAGA: Podczas konwersji z formatu stratnego, takiego jak JPEG, informacje o
stratność jest ważna. Wyjściowy plik DICOM będzie zawierał wymagany obraz stratny
Atrybut kompresji wskazujący, że obraz został gdzieś skompresowany stratnie
rurociąg. Zobacz także gdcmimg (ogólna lepsza obsługa JPEG).

WAŻNA UWAGA: Podczas używania –use-vtkdicom wyjściowy plik DICOM będzie zawsze zapisywany jako
Przechowywanie obrazów MR, ponieważ informacje te nie są dostępne w samym czytniku. To pozwala
prawidłowe ustawienie orientacji obrazu (pacjent).

Użyj gdcm2vtk online, korzystając z usług onworks.net