Jest to polecenie ilink, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przy użyciu jednej z wielu naszych bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
ilink - procedura optymalizacji GEMINI w celu znalezienia lokalnie optymalnej wartości wektora theta
frakcji rekombinacyjnych
STRESZCZENIE
iLink [Opcje] ipedfile.dat pedfile.dat
OPIS
Ta strona podręcznika opisuje pokrótce iLink Komenda. W rzeczywistości jest to bardzo surowy zamiar
udostępnienie strony podręcznika, ponieważ dystrybucja Debian GNU/Linux wymaga, aby każdy program:
mieć stronę podręcznika. Każde ulepszenie byłoby bardzo docenione.
iLink jest częścią szybki link pakiet oprogramowania.
ILINK wykorzystuje procedurę optymalizacji GEMINI, aby znaleźć lokalnie optymalną wartość theta
wektor frakcji rekombinacyjnych. Jeśli używasz domyślnych skryptów tworzonych przez lcp, twój
początkowe przypuszczenie dla theta to 1 w każdym wymiarze. Bliźnięta oceniają każdą theta według jej
prawdopodobieństwo, starając się znaleźć wektory theta, które mają większe prawdopodobieństwo rodowodu.
Procedura GEMINI ma wiele iteracji. Każda iteracja odpowiada jednej linii
wyjście. Każda iteracja obejmuje wiele ocen funkcji wiarygodności. Każda iteracja
ma dwie fazy. W fazie I GEMINI dąży do poprawy obecnego najlepszego theta. w fazie II,
GEMINI szacuje gradient prawdopodobieństwa w odniesieniu do aktualnego najlepszego theta
wektor. W pierwszej iteracji faza I ocenia prawdopodobieństwo tylko na początku
Kandydat theta.
Kiedy ILINK wydrukuje linię taką jak: maxcensor można zmniejszyć do -32767, to jest zakończone
pierwsza ocena funkcji wiarygodności. W przypadku długich serii fakt ten można wykorzystać do oszacowania
czas pracy. Rozsądne przybliżone oszacowanie liczby ocen funkcji to
10*(liczba wymiarów wektora theta). Liczba wymiarów wektora theta wynosi
w większości przypadków o jeden mniej niż liczba loci. Jeśli maletheta i femaletheta są dozwolone
się różnić (sexdif jest ustawione na 1), to liczba wymiarów podwaja się do 2 * (liczba
miejsce - 1). Oszacowanie innych parametrów (przy ustawieniu fitmodel na true) również może zwiększyć
liczba wymiarów.
Aby dowiedzieć się więcej na temat iLink przeczytanie pliku może być przydatne
/usr/share/doc/fastlink/README.ILINK jeśli masz system Debian GNU/Linux.
OPCJE
Możliwe, że są opcje, ale nie znalazłem żadnych informacji na ich temat. Proszę do przodu
wszelkie informacje na ich temat, aby[email chroniony]>
Korzystaj z ilink online, korzystając z usług onworks.net
