To jest polecenie mia-2dmyocard-ica, które można uruchomić w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online systemu MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
mia-2dmyocard-ica - Przeprowadź analizę ICA na serii obrazów 2D
STRESZCZENIE
mia-2dmyocard-ica -i [opcje]
OPIS
mia-2dmyocard-ica Ten program służy do przeprowadzania ICA podczas serii perfuzji mięśnia sercowego
obrazów w celu utworzenia syntetycznych odniesień, które można wykorzystać do korekcji ruchu na podstawie obrazu
rejestracja. Jeśli celem jest uruchomienie pełnej kompensacji ruchu, lepiej jest ją utworzyć
zestaw do segmentacji i użyj mia-2dmyoica-nonrigid. Jeżeli dane wejściowe podawane są za pomocą a
zestaw segmentacji, następnie można również użyć mia-2dmyocard-icaseries. Ten program jest
zasadniczo używany do testowania różnych opcji uruchamiania obrazu referencyjnego ICA
kreacja.
OPCJE
-i --in-base=(dane wejściowe, wymagane); ja
nazwa pliku wejściowego nazwa wzorca olloingXXXX.ext X=liczby Dla obsługiwanego pliku
typy zobacz WTYCZKI:2dimage/io
--coefs=
wyjściowe współczynniki miksowania do tego pliku
-o --out-base=(wyjście); strunowy
baza nazw plików wyjściowych
-t --typ=wyr
typ pliku wyjściowego
Utrzymany wartości są:( @, BMP, DCM, EXR, jpegi, JPG, PNG, SUROWY,
TIF, SPRZECZKA, V, WIDOK, bmp, dcm, ex, JPEG, jpg, png, surowy, dur plamisty,
sprzeczka, v, widok, )
-k --pomiń=2
pomiń obrazy na początku serii pomiń obrazy na początku serii
-e --koniec=60
ostatni obraz w seriiostatni obraz w serii
-C --komponenty=0
nr. składników, 0 = oszacowanie automatyczne nr. składników, 0 = oszacowanie
automatycznie
-m --średnia-paskowa
usuń średni obraz z serii
-f --zapisz funkcje=
zapisz obraz funkcji
-p --strip-periodic
usunąć tylko składnik okresowy
-x --max-ica-iteracje=0
max iteracji solwenta ICAmax iteracji solwera ICA
-n --ica-normalizuj
ica_normalize obrazy obiektów
--wszystkie funkcje=
zapisz wszystkie obrazy charakterystyczne w
-L --LV-amp-przycinania=0
Wzmocnienie maski przycięcia LV, 0.0 = nie przycinaj Wzmocnienie maski przycięcia LV, 0.0
= nie przycinaj
-a --auto-komponenty
automatyczne szacowanie ilości składowych na podstawie korelacji. Oznacza
-m i -n (eksperymentalne)
Pomoc & Informacia
-V --verbose=ostrzeżenie
gadatliwość wyjścia, komunikaty drukowane na danym poziomie i wyższych priorytetach.
Obsługiwane priorytety zaczynające się od najniższego poziomu to:
Informacje ‐ Komunikaty niskiego poziomu
wyśledzić ‐ Śledzenie wywołań funkcji
nie ‐ Zgłoś niepowodzenia testu
ostrzeżenie ‐ Ostrzeżenia
błąd ‐ Zgłoś błędy
debug ‐ Wyjście debugowania
wiadomość ‐ Normalne wiadomości
fatalny ‐ Zgłoś tylko błędy krytyczne
--prawa autorskie
drukuj informacje o prawach autorskich
-h --pomoc
wydrukuj tę pomoc
-? --stosowanie
wydrukuj krótką pomoc
--wersja
wydrukuj numer wersji i wyjdź
Przetwarzanie
--wątki=-1
Maksymalna liczba wątków do wykorzystania do przetwarzania, ta liczba powinna być mniejsza
lub równa liczbie rdzeni procesora logicznego w maszynie. (-1:
automatyczne oszacowanie). Maksymalna liczba wątków do wykorzystania do przetwarzania, to
liczba powinna być mniejsza lub równa liczbie rdzeni procesora logicznego w
maszyna. (-1: estymacja automatyczna).
WTYCZKI: obraz 2d/io
bmp Obsługa wejścia/wyjścia obrazu BMP 2D
Rozpoznawane rozszerzenia plików: .BMP, .bmp
Obsługiwane typy elementów:
dane binarne, 8 bitów bez znaku, 16 bitów bez znaku
pula danych Wirtualne IO do i z wewnętrznej puli danych
Rozpoznawane rozszerzenia plików: .@
dicom Obraz 2D io dla DICOM
Rozpoznawane rozszerzenia plików: .DCM, .dcm
Obsługiwane typy elementów:
16-bitowy ze znakiem, 16-bitowy bez znaku
exr wtyczka 2dimage io dla obrazów OpenEXR
Rozpoznawane rozszerzenia plików: .EXR, .exr
Obsługiwane typy elementów:
32-bitowe bez znaku, 32-bitowe zmiennoprzecinkowe
jpg wtyczka 2dimage io dla obrazów jpeg w skali szarości
Rozpoznawane rozszerzenia plików: .JPEG, .JPG, .jpeg, .jpg
Obsługiwane typy elementów:
8 bitów bez znaku
png wtyczka 2dimage io dla obrazów png
Rozpoznawane rozszerzenia plików: .PNG, .png
Obsługiwane typy elementów:
dane binarne, 8 bitów bez znaku, 16 bitów bez znaku
surowy Obsługa wyjścia obrazu RAW 2D
Rozpoznawane rozszerzenia plików: .RAW, .raw
Obsługiwane typy elementów:
dane binarne, 8-bitowy ze znakiem, 8-bitowy bez znaku, 16-bitowy ze znakiem, 16-bitowy bez znaku,
32-bitowy ze znakiem, 32-bitowy bez znaku, zmiennoprzecinkowy 32-bitowy, zmiennoprzecinkowy 64
bit
tif Obsługa wejścia/wyjścia obrazu TIFF 2D
Rozpoznawane rozszerzenia plików: .TIF, .TIFF, .tif, .tiff
Obsługiwane typy elementów:
dane binarne, 8 bitów bez znaku, 16 bitów bez znaku, 32 bity bez znaku
wzroku wtyczka 2dimage io dla obrazów Vista
Rozpoznawane rozszerzenia plików: .V, .VISTA, .v, .vista
Obsługiwane typy elementów:
dane binarne, 8-bitowy ze znakiem, 8-bitowy bez znaku, 16-bitowy ze znakiem, 16-bitowy bez znaku,
32-bitowy ze znakiem, 32-bitowy bez znaku, zmiennoprzecinkowy 32-bitowy, zmiennoprzecinkowy 64
bit
PRZYKŁAD
Oceń syntetyczne odniesienia z obrazów imageXXXX.exr i zapisz je w refXXXX.exr
używając pięciu niezależnych komponentów, oznacza to usuwanie, normalizowanie i pomijanie 2 obrazów.
mia-2dmyocard-ica -i imageXXXX.exr -o ref -k 2 -C 5 -m -n
Autorski)
Gerta Wollnego
PRAWA AUTORSKIE
To oprogramowanie jest objęte prawami autorskimi (c) 1999‐2015 Lipsk, Niemcy i Madryt, Hiszpania. Nadchodzi
bez ABSOLUTNIE ŻADNEJ GWARANCJI i możesz ją redystrybuować zgodnie z warunkami GNU
OGÓLNA LICENCJA PUBLICZNA W wersji 3 (lub nowszej). Aby uzyskać więcej informacji, uruchom program za pomocą
opcja '--prawa autorskie'.
Używaj mia-2dmyocard-ica online, korzystając z usług onworks.net