GoGPT Best VPN GoSearch

Ulubiona usługa OnWorks

TransDecoder.Predict – online w chmurze

Uruchom TransDecoder.Predict w darmowym dostawcy hostingu OnWorks przez Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows lub emulator online MAC OS

Jest to polecenie TransDecoder.Predict, które można uruchomić w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks przy użyciu jednej z wielu naszych bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online MAC OS

PROGRAM:

IMIĘ


Transdekoder - prognoza białka transkryptomu

ZASTOSOWANIE


Wymagany:

-T transkrypty.fasta

Wspólne opcje:

--retain_long_orfs zachować wszystkie znalezione ORF, które są równe lub dłuższe niż te wiele nukleotydów, nawet jeśli nie ma innych dowodów
oznacza to jako kodowanie (domyślnie: 900 bp => 300aa)

--retain_pfam_hits /ścieżka/do/pfam_db.hmm, aby wyszukać
za pomocą hmmscan (który powinien być dostępny za pośrednictwem ustawienia PATH)

--retain_blastp_hits

Opcje zaawansowane

--pociąg plik FASTA z ORF do trenowania Markov Mod do identyfikacji białek; W przeciwnym razie
najdłuższe używane nieredundantne ORF

-T Jeśli nie --train, najdłuższe ORF do trenowania modelu Markowa (statystyki heksameru) (domyślnie: 500)

2015-12-28 TRANSDEKODER.PRZEWIDYWANIE(1)

Korzystaj z TransDecoder.Predict online, korzystając z usług onworks.net


Darmowe serwery i stacje robocze

Pobierz aplikacje Windows i Linux

Komendy systemu Linux

Ad




×
reklama
❤️Zrób zakupy, zarezerwuj lub kup tutaj — bezpłatnie, co pomaga utrzymać bezpłatne usługi.