To jest aplikacja dla systemu Linux o nazwie Autoprime, działająca w systemie Linux online, której najnowszą wersję można pobrać jako autoprime.2.1.tar.gz. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online aplikację o nazwie Autoprime, która będzie działać bezpłatnie w systemie Linux online z OnWorks.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZRZUTY EKRANU
Ad
Autoprime do uruchomienia w systemie Linux online
OPIS
AutoPrime umożliwia szybkie projektowanie starterów do pomiaru ekspresji eukariotycznej metodą PCR w czasie rzeczywistym.Łącząc się z bazą danych EnsEMBL, informacje o strukturze genów są wykorzystywane do znajdowania starterów obejmujących granice eksonów. W ten sposób przechwytywane są tylko sekwencje wyrażone. Dodatkowo można uniknąć błędnego primingu w powtarzających się regionach, korzystając z informacji z RepBase.
Funkcje
- Zautomatyzowane projektowanie podkładów
- Kontrola jakości poprzez szczegółowe ustawienia
- Korzystając ze znanych źródeł: Primer3, EnsEMBL, RepBase
- Tworzę swoje podkłady od 2003 roku
- Strona internetowa działająca jako usługa
- Kod Perla dostępny do lokalnego wykonania
Publiczność
Nauka/badania, zaawansowani użytkownicy końcowi
Interfejs użytkownika
Internetowy, wiersz poleceń
Język programowania
Perl
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/autoprime/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
