Jest to aplikacja dla systemu Linux o nazwie Biological Pathway Exchange Language, działająca w systemie Linux online, której najnowszą wersję można pobrać jako paxtools-5.1.0.jar. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online aplikację o nazwie Biological Pathway Exchange Language, która będzie działać bezpłatnie w systemie Linux online z OnWorks.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
Język wymiany ścieżek biologicznych do działania w systemie Linux online
Ad
OPIS
BioPAX to standardowy język do integracji, wymiany, wizualizacji i analizy danych szlaków biologicznych. BioPAX obsługuje wymianę danych między grupami danych szlaku, a tym samym zmniejsza złożoność wymiany między formatami danych, zapewniając akceptowany standardowy format danych szlaku. Oferując standard, z dobrze zdefiniowaną semantyką do reprezentacji szlaków, BioPAX umożliwia bardziej wydajną interakcję z bazami danych szlaków i oprogramowaniem. Ponadto BioPAX umożliwia rozwój wizualizacji szlaków z baz danych i ułatwia analizę eksperymentalnie wygenerowanych danych poprzez połączenie z wcześniejszą wiedzą. Wysiłki BioPAX są ściśle koordynowane z innymi inicjatywami dotyczącymi standardów związanych ze ścieżką, a mianowicie; PSI-MI, SBML, CellML i SBGN w celu zapewnienia kompatybilnego standardu w obszarach, w których się pokrywają.Funkcjonalności
- Dokumentacja i przykłady BioPAX
- Paxtools (API BioPAX)
- Walidator BioPAX
- Konwertery BioPAX
Publiczność
Nauka/Badania
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/biopax/. Jest hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.