Jest to aplikacja dla systemu Linux o nazwie FASTQSim do działania w systemie Linux online, której najnowszą wersję można pobrać jako FASTQsim_v2.0.tgz. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online aplikację o nazwie FASTQSim, która będzie działać bezpłatnie w systemie Linux online z OnWorks.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
FASTQSim do uruchomienia w systemie Linux online
Ad
OPIS
FASTQSim to narzędzie, które zapewnia podwójną funkcjonalność charakteryzacji zestawu danych sekwencjonowania nowej generacji i generowania danych metagenomicznych.FASTQSim jest sekwencjonowaniem niezależnym od platformy i oblicza dystrybucje długości odczytu, wyników jakości, współczynników indel, współczynników mutacji pojedynczych punktów, rozmiaru indel i podobnych statystyk dla dowolnego sekwencjonowania
platforma. Aby tworzyć zestawy danych treningowych lub testowych, FASTQSim ma możliwość konwersji sekwencji docelowych na odczyty in silico z dopasowaniem
profile błędów.
FASTQsim pozwala użytkownikowi symulować poszczególne odczytane zestawy danych, które można wykorzystać jako standardowe scenariusze testowe do planowania projektów sekwencjonowania lub do testowania oprogramowania metagenomicznego. Pod tym względem zestawy danych in silico generowane za pomocą narzędzia FASTQsim mają kilka zalet w porównaniu z naturalnymi zestawami danych: są niezależne od platformy sekwencjonowania, wyjątkowo dobrze scharakteryzowane i tańsze w generowaniu.
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/fastqsim/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
