Jest to aplikacja dla systemu Linux o nazwie GenOO-HTS do działania w systemie Linux online, której najnowszą wersję można pobrać jako genoo-code-2013_04_18.tar.gz. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online aplikację o nazwie GenOO-HTS, która będzie działać bezpłatnie w systemie Linux online z OnWorks.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZRZUTY EKRANU
Ad
GenOO-HTS do uruchomienia w systemie Linux online
OPIS
GenOO-HTS [jee-noo] jest oprogramowaniem typu open source; obiektowo zorientowany framework Perla opracowany specjalnie do projektowania narzędzi analitycznych High Throughput Sequencing (HTS). Podstawowym celem GenOO-HTS jest uczynienie prostych analiz HTS łatwymi i umożliwieniem skomplikowanych analiz. GenOO-HTS modeluje jednostki biologiczne w obiekty Perla i zapewnia odpowiednie atrybuty i metody, które pozwalają na manipulowanie danymi sekwencjonowania o dużej przepustowości. Używanie GenOO-HTS jako podstawowego modułu rozwojowego zmniejsza obciążenie i złożoność zarządzania danymi i dostępnymi jednostkami biologicznymi. GenOO-HTS został zaprojektowany z myślą o elastyczności, łatwej rozbudowie, modułowej strukturze i minimalnych wymaganiach dotyczących zewnętrznych narzędzi i bibliotek.Funkcjonalności
- Organizuj jednostki biologiczne jako obiekty Perla (regiony genomowe, geny, transkrypty, introny/eksony itp.)
- Organizuj elementy sekwencjonowania jako obiekty/atrybuty Perla (odczyty sekwencjonowania, wyrównania itp.)
- Ułatw sobie operacje we/wy w powszechnie używanych formatach plików (SAM, BED, FASTA, FASTQ)
- Bądź spójny i łatwy do rozszerzenia
Publiczność
Nauka/Badania, Deweloperzy
Język programowania
Perl
Jest to aplikacja, którą można również pobrać ze strony https://sourceforge.net/projects/genoo/. Został on hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
