Jest to aplikacja dla systemu Linux o nazwie GMATA software for Genomic SSR marker, której najnowszą wersję można pobrać jako GMATAv2.2.jar. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie GMATA software for Genomic SSR marker with OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZRZUTY EKRANU
Ad
Oprogramowanie GMATA dla markera genomowego SSR
OPIS
Co to jest oprogramowanie GMATA v21
Genome-wide Microsatellite Analyzing Toward Application (GMATA) to oprogramowanie do analiz prostych powtórzeń sekwencji (SSR) oraz projektowania i mapowania markerów SSR w dowolnych sekwencjach DNA. Ma następujące funkcje:
1. wydobycie SSR;
2. Analiza statystyczna i wykreślanie;
3. Przegląd graficzny loci SSR;
4. Projektowanie znaczników;
5. Elektroniczne mapowanie i badanie możliwości przenoszenia znaczników.
GMATA jest dokładny, czuły i szybki. Został zaprojektowany do przetwarzania dużych zbiorów danych sekwencji genomowych, zwłaszcza dużych sekwencji całych genomów. Teoretycznie genomy dowolnej wielkości mogą być łatwo analizowane przez GMATA. Oprogramowanie GMATA działa na serwerze, komputerze stacjonarnym, a nawet laptopie i może działać w interfejsie graficznym za pomocą kliknięć lub uruchamiać w wierszu poleceń lub w zautomatyzowanym potoku. Jest również wieloplatformowy i obsługuje systemy Unix/Linux, Win i Mac. Wyniki z oprogramowania GMATA można bezpośrednio wyświetlić graficznie wraz z cechami genomu lub genu w Gbrowser i łatwo zintegrować z dowolną genomową bazą danych.
Korzyści
- Dokładne i najszybsze wydobywanie SSR w dowolnych dużych sekwencjach
- Kompletna analiza statystyczna i wykreślanie
- Loci SSR i grafika znaczników wyświetlana w Gbrowser z funkcjami genomu
- Projektowanie specyficznych markerów SSR i symulacja PCR
- Mapowanie elektroniczne i badanie możliwości przenoszenia znaczników
- dostępne również na https://github.com/XuewenWangUGA/GMATA.git
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/gmata/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
