To jest aplikacja Linuksa o nazwie Kinannote do uruchomienia w Linuksie online, której najnowszą wersję można pobrać jako Kinannote_1.0.tar. Można ją uruchomić online w darmowym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom bezpłatnie aplikację Kinannote, aby uruchomić ją w systemie Linux online z OnWorks.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZRZUTY EKRANU
Ad
Kinannote będzie działać w systemie Linux online
OPIS
Kinannote identyfikuje i klasyfikuje kinazy białkowe w dostarczonym przez użytkownika pliku fasta przy użyciu HMM pochodzącego z kinaz białkowych serynowo/treoninowych, macierzy punktacji specyficznej dla pozycji pochodzącej z HMM oraz porównania z lokalną wersją wyselekcjonowanej bazy danych kinaz z kinaza.com. Jeśli użytkownik wprowadzi kompletny proteom, dodatkowe moduły oceniają kompletność kinomu i umieszczają go w kontekście z kinomami referencyjnymi. Kinannote działa w wierszu poleceń systemu Unix i zależy od lokalnych instalacji hmmer 2 i Blast 2.24.Cytując Kinannote:
Kinannote, program komputerowy do identyfikacji i klasyfikacji członków nadrodziny eukariotycznych kinaz białkowych
Jonathana M. Goldberga; Allison Griggs; Janet L. Smith; Briana Haasa; Jennifer Wortman; Qiandong Zeng
Bioinformatyka 2013; doi: 10.1093/bioinformatyka/btt419
http: http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/29/19/2387.full
PDF: http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/29/19/2387.full.pdf+html
Publiczność
Nauka/Badania
Język programowania
Perl
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/kinannote/. Jest hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
