Jest to aplikacja dla systemu Linux o nazwie VCF Explorer do działania w systemie Linux online, której najnowszą wersję można pobrać jako VCFExplorer.tar.gz. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online aplikację o nazwie VCF Explorer, która będzie działać bezpłatnie w systemie Linux online z OnWorks.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZRZUTY EKRANU
Ad
VCF Explorer do uruchomienia w systemie Linux online
OPIS
Zmniejszające koszty technologie o wysokiej przepustowości doprowadziły do wielu projektów sekwencjonowania obejmujących tysiące całych genomów. Zmiana paradygmatu z egzomu na cały genom przynosi znaczny wzrost rozmiaru plików wyjściowych. Większość istniejących narzędzi opracowanych do analizy plików exome nie jest odpowiednia dla dużych plików VCF tworzonych w ramach badań całego genomu. W tej pracy przedstawiamy VCF-Explorer, oprogramowanie do analizy wariantów zdolne do obsługi dużych plików. Wydajne zarządzanie pamięcią programu oraz wyeliminowanie etapu wstępnej analizy składniowej umożliwia przeprowadzenie analizy na zwykłych komputerach. VCF-Explorer to łatwe w użyciu środowisko, w którym można definiować różne typy zapytań o adnotacje i próbki. VCF-Explorer można uruchomić w różnych środowiskach i platformach obliczeniowych, od standardowego laptopa po zaawansowany serwer.Funkcjonalności
- Łatwe w użyciu środowisko
- Efektywne zarządzanie pamięcią
- Przetwarzanie dużych (całego genomu) plików VCF
- Działa na komputerze osobistym o ograniczonych zasobach obliczeniowych
Interfejs użytkownika
Qt
Język programowania
C++, C
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/vcfexplorer/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
