Jest to aplikacja systemu Windows o nazwie MetaPhat -meta-pheno-association-tracker, której najnowszą wersję można pobrać jako plasma_lipids_decomposed.zip. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie MetaPhat -meta-pheno-association-tracker z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom dowolny emulator online systemu operacyjnego OnWorks z tej witryny, ale lepszy emulator online systemu Windows.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Windows, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację i zainstaluj ją.
- 7. Pobierz Wine z repozytoriów oprogramowania dystrybucji Linuksa. Po zainstalowaniu możesz dwukrotnie kliknąć aplikację, aby uruchomić ją za pomocą Wine. Możesz także wypróbować PlayOnLinux, fantazyjny interfejs w Wine, który pomoże Ci zainstalować popularne programy i gry Windows.
Wine to sposób na uruchamianie oprogramowania Windows w systemie Linux, ale bez systemu Windows. Wine to warstwa kompatybilności z systemem Windows typu open source, która może uruchamiać programy systemu Windows bezpośrednio na dowolnym pulpicie systemu Linux. Zasadniczo Wine próbuje ponownie zaimplementować system Windows od podstaw, aby mógł uruchamiać wszystkie te aplikacje Windows bez faktycznego korzystania z systemu Windows.
ZRZUTY EKRANU
Ad
MetaPhat - narzędzie do śledzenia skojarzeń meta-feno
OPIS
MetaPhat to program typu open source do wykrywania optymalnych cech podzbioru w wiodących asocjacjach SNP z wielu wyników zbiorczych GWAS biomarkerów. Najlepsze cechy pochodzą z systematycznego rozkładu powiązań wielowymiarowych na cechy centralne w oparciu o optymalne BIC i wartość P z wielowymiarowych modeli CCA. Wyniki śledzenia SNP są wykreślane i grupowane, aby przeanalizować i poprawić specyficzność powiązań fenotyp-genotyp mv.
zwalniany z funkcją LD https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/files/Dist/meta_phat.tar.gz/download
Szybki start https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Quick%20Start
Wejścia https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Inputs
Globalny przykład lipidów https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Installation_global_lipids
Cytowanie: Lin i in. (2020) MetaPhat: Wykrywanie i rozkładanie powiązań wielowymiarowych na podstawie jednowymiarowych statystyk asocjacyjnych obejmujących cały genom. Przód. Genet. doi: 10.
Korzyści
- wielowymiarowa analiza cech całego genomu
- Wybór optymalnego podzbioru cech na podstawie wartości p i BIC
- wykresy śladowe rozkładu cech
- Zlepianie populacji i bloków LD
- główny plik podsumowania cech SNP i kierowcy
- snp-snp cecha ranga klaster włóczników
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/. Jest hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.