Jest to aplikacja dla systemu Windows o nazwie Analizator motywów skojarzonych z Microarray, działająca w systemie Windows online za pośrednictwem systemu Linux online, której najnowszą wersję można pobrać jako MAMA_latest.zip. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online aplikację o nazwie Analizator motywów skojarzonych z Microarray, która będzie działać bezpłatnie w systemie Windows online przez Linux online z OnWorks.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom dowolny emulator online systemu operacyjnego OnWorks z tej witryny, ale lepszy emulator online systemu Windows.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Windows, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację i zainstaluj ją.
- 7. Pobierz Wine z repozytoriów oprogramowania dystrybucji Linuksa. Po zainstalowaniu możesz dwukrotnie kliknąć aplikację, aby uruchomić ją za pomocą Wine. Możesz także wypróbować PlayOnLinux, fantazyjny interfejs w Wine, który pomoże Ci zainstalować popularne programy i gry Windows.
Wine to sposób na uruchamianie oprogramowania Windows w systemie Linux, ale bez systemu Windows. Wine to warstwa kompatybilności z systemem Windows typu open source, która może uruchamiać programy systemu Windows bezpośrednio na dowolnym pulpicie systemu Linux. Zasadniczo Wine próbuje ponownie zaimplementować system Windows od podstaw, aby mógł uruchamiać wszystkie te aplikacje Windows bez faktycznego korzystania z systemu Windows.
Analizator motywów związany z mikromacierzami do działania w systemie Windows online w systemie Linux online
Ad
OPIS
Opracowaliśmy nowatorską metodę wolną od grupowania, analizator motywów związanych z mikromacierzami (MAMA), aby przewidywać nowe elementy działające w układzie cis w oparciu o ważone podobieństwa sekwencji i profile ekspresji genów w analizach mikromacierzy. Symulację ekspresji genów przeprowadzono przy użyciu maszyny wektorów nośnych i w oparciu o obecność przewidywanych motywów i par motywów. Dokładność symulowanej ekspresji genów wykorzystano do oceny jakości przewidywań i optymalizacji parametrów stosowanych w tej metodzie. Po optymalizacji MAMA dokładnie symulowała ponad 87% ekspresji genów.Patrz Kakei Y, Ogo Y, Itai RN i in. (2013) Opracowanie nowatorskiej metody przewidywania pierwiastków cis w celu postawienia hipotezy o wspólnych funkcjach par pierwiastków cis u osób z niedoborem żelaza. Ryż 6(1): 22.
Publiczność
Nauka/Badania
Interfejs użytkownika
Wiersz poleceń
Język programowania
Pythona, Perla, C
Jest to aplikacja, którą można również pobrać ze strony https://sourceforge.net/projects/microarray-motif-analyzer/. Został on hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
