To jest aplikacja dla systemu Windows o nazwie UniPyRange, której najnowszą wersję można pobrać jako UniPyRangeSuite.py. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie UniPyRange z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom dowolny emulator online systemu operacyjnego OnWorks z tej witryny, ale lepszy emulator online systemu Windows.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Windows, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację i zainstaluj ją.
- 7. Pobierz Wine z repozytoriów oprogramowania dystrybucji Linuksa. Po zainstalowaniu możesz dwukrotnie kliknąć aplikację, aby uruchomić ją za pomocą Wine. Możesz także wypróbować PlayOnLinux, fantazyjny interfejs w Wine, który pomoże Ci zainstalować popularne programy i gry Windows.
Wine to sposób na uruchamianie oprogramowania Windows w systemie Linux, ale bez systemu Windows. Wine to warstwa kompatybilności z systemem Windows typu open source, która może uruchamiać programy systemu Windows bezpośrednio na dowolnym pulpicie systemu Linux. Zasadniczo Wine próbuje ponownie zaimplementować system Windows od podstaw, aby mógł uruchamiać wszystkie te aplikacje Windows bez faktycznego korzystania z systemu Windows.
ZRZUTY EKRANU
Ad
UniPyRange
OPIS
Bardzo prosty skrypt Pythona, który zaoszczędzi Ci trudu liczenia aminokwasów/zasad DNA w plikach fasta z bazy danych Uniprot i NCBI RefSeq (1, 2).
Powiedzmy, że chcesz sekwencję aminokwasów z zakresu 128-387 z białka o długości 1000 aminokwasów - ten skrypt pomoże Ci uniknąć błędów w liczeniu pokazując tylko określoną sekwencję aminokwasów i kodując pary zasad DNA (idealny do projektowania starterów do amplifikacji ) o określonym identyfikatorze Uniprot.
- Wymaga BioPython (3) i Bioservices Package (4)
(1)
Konsorcjum UniProt
UniProt: centrum informacji o białkach
Kwasy nukleinowe Res. 43: D204-D212 (2015).
(2)
RefSeq: aktualizacja sekwencji referencyjnych ssaków. Kwasy nukleinowe Res. 2014 stycznia 1 r.;42(1):D756-63.
(3)
Kogut PJ i in. Bioinformatyka (2009)
(4)
Cokelaer i in., Bioinformatyka (2013)
Język programowania
Python
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/unipyrange/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.