Este é o comando bowtie2-inspect que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS
PROGRAMA:
NOME
bowtie2-inspect - invólucro para o índice bowtie2-inspect- *
SINOPSE
bowtie2-inspecionar [opções]*
DESCRIÇÃO
Bowtie 2 versão 2.2.6 por Ben Langmead ([email protegido], www.cs.jhu.edu/~langmea)
nome do arquivo bt2 menos .1.bt2 / .2.bt2 à direita
Por padrão, imprime registros FASTA das sequências de nucleotídeos indexadas para padrão
Fora. Com -n, apenas imprime nomes. Com -s, apenas imprime um resumo do índice
parâmetros e sequências. Com -e, preserva as cores, se aplicável.
OPÇÕES
--grande-índice
forçar a inspeção do índice 'grande', mesmo que um 'pequeno' esteja presente.
-a/--entre
Número de caracteres na saída FASTA (padrão: 60)
-n/ - nomes
Imprimir nomes de sequência de referência apenas
-s/--resumo
Imprimir resumo incl. nomes de ref, comprimentos, propriedades de índice
-e/ - bt2-ref
Reconstruir a referência de .bt2 (lento, preserva as cores)
-v/ - verboso
Saída detalhada (para depuração)
-h/--ajuda
imprimir descrição detalhada da ferramenta e suas opções
--Socorro imprimir esta mensagem de uso
Use o bowtie2-inspect online usando os serviços onworks.net
