cmtk-groupwise_affine - Online na nuvem

PROGRAMA:

NOME

groupwise_affine - registro de população afim

SINOPSE

groupwise_affine [opções] imagem0 [imagem1 ...]

DESCRIÇÃO

Esta ferramenta registra uma população de imagens de entrada simultaneamente, sem um modelo, usando
ou o algoritmo de 'congelamento' ou uma medida de similaridade de grupo com base em uma
aproximação de informação mútua ('RMI').

OPÇÕES

Global Kit de ferramentas Opções (estes e guarante que os mesmos estão compartilhado by todos os CMTK Ferramentas)
--Socorro
Grave uma lista de opções básicas de linha de comando na saída padrão.

--ajuda-tudo
Escreva uma lista completa de opções de linha de comando básicas e avançadas na saída padrão.

--wiki
Escreva uma lista de opções de linha de comando para a saída padrão na marcação MediaWiki.

--cara
Grave o código-fonte da página de manual na marcação 'nroff' para a saída padrão.

--versão
Grave a versão do kit de ferramentas na saída padrão.

--eco
Grave a linha de comando atual na saída padrão.

--nível detalhado
Defina o nível de verbosidade.

--verbose, -v
Aumentar o nível de detalhamento em 1 (obsoleto; com suporte para compatibilidade com versões anteriores).

--tópicos
Defina o número máximo de threads paralelos (para threads POSIX e OpenMP).

Registo métrico Opções
--rmi
Use a métrica RMI (também conhecida como informações mútuas regionais) para conduzir o registro).

--congelar
Use o algoritmo de congelamento usando entropias de pilha pixelwise para conduzir o
cadastro. [Este is que o predefinição]

Modelo Imagem Opções
--modelo , -t
Nome de arquivo de entrada para imagem de modelo predefinida. [Predefinição: NENHUM]

--modelo com dados , -T
Use os dados de pixel das imagens de modelo fornecidas pelo usuário no registro [Predefinição: Desativado]

saída Opções
--output-root , -O
Diretório raiz para todos os arquivos de saída. [Predefinição: NENHUM]

--resultado , -o
Nome do arquivo de saída para o arquivo de registro do groupwise. [Predefinição: groupwise.xforms ]

--média de saída
Nome do arquivo de saída para a imagem média registrada. [Predefinição: média.nii ]

--média-linear
Use interpolação linear para imagem média [Este is que o predefinição]

- média cúbica
Use interpolação cúbica para imagem média

--sem média de saída
Não escreva imagem média.

Multirresolução parâmetros
- downsample-from , -d
Fator de redução da resolução inicial [Predefinição: 4]

- downsample-to , -D
Fator de redução da resolução final. [Predefinição: 1]

- densidade de amostragem , -s
Densidade de amostragem probabilística. Valores legais entre 0 e 1. [Predefinição: Desativado]

Imagem Opções e Operações
--force-background , -B
Força os pixels de fundo (fora do FOV) para um determinado valor (bin). [Predefinição: Desativado]

--histograma-bins , -H
Definir manualmente o número de caixas de histograma para avaliação de entropia [Predefinição: Desativado]

--crop-histogramas
Corte histogramas de imagem para usar melhor os compartimentos de histograma.

--suave
Sigma do kernel de suavização gaussiana em múltiplos do tamanho do pixel da imagem do template.
[Predefinição: Desativado]

--match-histogramas
Combine todos os histogramas de imagem com os dados do modelo (ou a primeira imagem, se nenhuma imagem do modelo for
dado)

--livre e releia
Libere memória alocada para a imagem original sempre que não forem necessários e releia
arquivos de imagem conforme necessário. Isso pode ser útil ao executar em uma máquina com
recursos de memória.

Transformação parâmetros
--dofs [, , ...]
Adicionar DOFs à lista [padrão: uma passagem, 6 DOF]

- soma zero, -z
Imponha computação de soma zero.

--normal-grupo-primeiro-n , -N
As primeiras N imagens são do grupo normal e devem ser registradas sem distorções.
[Predefinição: 0]

- soma-zero-primeiro-n , -Z
Imponha computação de soma zero para as primeiras N imagens. [Predefinição: Desativado]

Transformação Inicialização
--align-bounding-boxes
Alinhe inicialmente os centros das caixas delimitadoras de todas as imagens por translação [Este is que o
predefinição]

--alinhar-centros-de-massa
Alinhe inicialmente os centros de massa por translação

--init-escalas
Inicializar fatores de escala usando momentos de primeira ordem

Operacional parâmetros
--exploração , -e
Exploração de otimização em pixels [Predefinição: 0.25]

--precisão , -a
Precisão de otimização em pixels [Predefinição: 0.01]

- nível de repetição , -r
Número de repetições por nível de otimização [Predefinição: 5]

--fator de passo , -S
Fator de etapa para sucessivas etapas de otimização [Predefinição: 0.5]

--delta-f-limiar
Limite opcional para encerrar a otimização (nível) se houver mudança relativa de destino
função cai abaixo deste valor. [Predefinição: 0]

--desabilitar-otimização
Desative a otimização e a configuração inicial de saída.

AUTORES

Torsten Rohlfing, com contribuições de Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff e Yaroslav Halchenko

Use cmtk-groupwise_affine online usando serviços onworks.net