Este é o comando fastq-multx que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS
PROGRAMA:
NOME
fastq-multx - ea-utils: substitua% pelo id do código de barras no arquivo de códigos de barras
SINOPSE
fastq-multix [-g | -l | -B] -o r1.%. fq [companheiro.fq -o r2.%. fq] ...
DESCRIÇÃO
fastq-multx: opção inválida -- 'h' Opção desconhecida `-h '.
Versão: 1.02.684
Os arquivos de saída devem conter um sinal de '%' que é substituído pelo ID do código de barras nos códigos de barras
Arquivo. O arquivo de saída pode ser n / a para descartar os dados correspondentes (use isso para o código de barras
leitura)
Arquivo de códigos de barras (-B) se parece com isso:
...
O padrão é adivinhar o -tigela or -eol com base em estatísticas claras.
If -g é usado, então seu parâmetro é uma faixa de índice, e as sequências de ocorrência frequente são
usava.
If -l é usado, então todos os códigos de barras no arquivo são testados, e o * grupo * com a * maioria *
partidas é escolhido.
Arquivo de códigos de barras agrupados (-l or -L) se parece com isso:
...
Leituras acopladas, se fornecidas, são mantidas em sincronia
OPÇÕES
-o Arquivos de saída FIL1 (um por entrada, obrigatório) -g SEQFIL Determinar códigos de barras de
indexado ler SEQFIL -l BCFIL Determina códigos de barras de qualquer leitura, usando BCFIL como mestre
Lista -L BCFIL Determinar códigos de barras de , usando BCFIL como lista mestre -B BCFIL
Use códigos de barras do arquivo especificado, não execute uma etapa de determinação -b força
início da linha (5 ') para correspondência de código de barras -e Forçar fim de linha (3 ') para batcode
correspondente -t NUM Limite de divisão para autodeterminação pelo fator NUM (1),> 1 = mais
sensível -G NAME Use grupo (s) correspondente (s) apenas a NAME -x Não apare os códigos de barras
antes de escrever o destino -n Não execute, apenas imprima a lista de códigos de barras provável
-v C Verifique se os id correspondentes correspondem ao caractere C (use '' para iluminar) -m N
Permitir até N incompatibilidades, desde que sejam exclusivas (1) -d N requer um mínimo
distância de N entre o melhor e o próximo melhor (2) -q N Requer um mínimo de phred
qualidade de N para aceitar uma base de código de barras (0)
Use fastq-multx online usando serviços onworks.net
