Este é o comando hmm2fetch que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS
PROGRAMA:
NOME
hmm2fetch - recupera um HMM de um banco de dados HMM
SINOPSE
hmm2fetch [opções] banco de dados nome
DESCRIÇÃO
hmm2fetch é um pequeno utilitário que recupera um HMM chamado nome de um banco de dados modelo HMMER
chamado base de dados. em um novo formato e imprime esse modelo na saída padrão. Por exemplo,
hmm2fetch Pfam rmm recupera o modelo RRM (motivo de reconhecimento de RNA) de Pfam, se o
a variável de ambiente HMMERDB é definida para a localização do banco de dados Pfam. O recuperado
O arquivo HMM é gravado no formato HMMER 2 ASCII.
O banco de dados deve ter um arquivo de índice GSI associado. Para indexar um banco de dados HMM, use o
programa índice hmm2.
OPÇÕES
-h Imprima uma breve ajuda; inclui o número da versão e um resumo de todas as opções, incluindo
opções de especialistas.
-n Interpretar nome como um número HMM em vez de um nome. A numeração começa em 0. Para
exemplo, para buscar o primeiro HMM de um banco de dados HMM chamado cara, você faria
hmm2fetch -n 0 foo.
Use hmm2fetch online usando serviços onworks.net
