Este é o comando indigo-cano que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador Windows online ou emulador MAC OS online
PROGRAMA:
NOME
indigo-cano - produz SMILES canônicos ou código em camadas para moléculas no formato MOL ou SDF
SINOPSE
índigo-canoa nome do arquivo. {mol, rdf, rdf.gz, sdf, sdf.gz, smi} [parâmetros]
índigo-canoa - SMILES [parâmetros]
DESCRIÇÃO
índigo-canoa é usado para produzir SMILES canônicos ou código em camadas para moléculas em MOL ou
Formato SDF.
OPÇÕES
índigo-canoa espera um arquivo ou código SMILES na entrada padrão, que então pode ser
seguido por um ou mais dos seguintes parâmetros.
- sorrisos
Saída de SMILES canônicos (padrão)
-camada
Código canônico em camadas de saída
-Eu iria
Campo de ID com o nome fornecido em um arquivo SDF
-sem aroma
Não aromatize moléculas
-não-tetraédrico
Ignorar estereocentros tetraédricos
-não-cistrans
Ignorar informações de ligações cis-trans
EXEMPLOS
índigo-canoa arquivo.sdf
índigo-canoa arquivo.sdf.gz -Eu iria Molregno > resultados.txt
índigo-canoa arquivo.smi -camada -não-cistrans
índigo-canoa - 'NC1C = CC (O) = CC = 1'
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