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masai_output_pe - Online na nuvem

Execute masai_output_pe no provedor de hospedagem gratuita OnWorks no Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS

Este é o comando masai_output_pe que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online Windows ou emulador online MAC OS

PROGRAMA:

NOME


masai_output_pe - Saída Masai - Modo Final Emparelhado

SINOPSE

masai_output_pe [OPÇÕES]


DESCRIÇÃO

Masai é um mapeador de leitura rápida e precisa baseado em sementes aproximadas e múltiplas
retrocedendo.

See http://www.seqan.de/projects/masai para obter mais informações.

(c) Copyright 2011-2012 de Enrico Siragusa.

-h, --Socorro

Exibe esta mensagem de ajuda.

--versão

Exibir informações de versão

Opções de emparelhamento:

-ng, - sem lacunas

Não alinhe leituras com lacunas.

-todos, - comprimento da biblioteca NUM

Comprimento da biblioteca. Padrão: 220.

Eles, --library-error NUM

Tolerância do comprimento da biblioteca. Padrão: 50.

Opções de saída:

-t, --tmp-pasta STR

Especifique uma pasta temporária grande. Padrão: use a pasta genoma.

-o, --arquivo de saída ARQUIVO

Especifique um arquivo de saída. Padrão: use o prefixo lê o nome do arquivo. Tipos de arquivos válidos
são: raw e sam.

-nc, - sem charuto

Não produza string CIGAR. Isso afeta apenas a saída do SAM.

Opções de depuração:

-WL, --sem despejo

Não despeje os resultados.

VERSÃO

masai_output_pe version: 0.7.1 [14053] Última atualização 2013-05-16

Use masai_output_pe online usando serviços onworks.net


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