mia-2dmyocard-ica - Online na nuvem

PROGRAMA:

NOME

mia-2dmyocard-ica - Execute uma análise ICA em uma série de imagens 2D

SINOPSE

mia-2dmiocard-ica -i [opções]

DESCRIÇÃO

mia-2dmiocard-ica Este programa é usado para executar um ICA em uma série de perfusão miocárdica
imagens para criar referências sintéticas que podem ser usadas para correção de movimento por imagem
cadastro. Se o objetivo é executar uma compensação de movimento total, então é melhor criar
um conjunto de segmentação e use mia-2dmyoica-nonrigid. Se os dados de entrada forem fornecidos por meio de um
conjunto de segmentação, em seguida, também pode usar mia-2dmyocard-icaseries. Este programa é
essencialmente usado para testar diferentes opções sobre como executar a imagem de referência do ICA
criação.

OPÇÕES

-i --in-base = (entrada, obrigatório); io
nome do arquivo de entrada do nome do padrão de acompanhamentoXXXX.ext X = números Para o arquivo suportado
tipos, consulte PLUGINS: 2dimage / io

--coefs =
coeficientes de mistura de saída para este arquivo

-o --out-base = (saída); fragmento
base do nome do arquivo de saída

-t --tipo = exr
tipo de arquivo de saída
Suportado valores estão:( @, BMP, DCM, EX, Jpeg, JPEG, PNG, CRU,
TIF, TIFF, V, VISÃO, bmp, cmd, ex, JPEG, jpg png, cru, tif,
briga, v, vista )

-k --skip = 2
pular imagens no início da série, pular imagens no início da série

-e --end = 60
última imagem da série última imagem da série

-C --components = 0
nº de componentes, 0 = estimativa automáticanr. de componentes, 0 = estimativa
automaticamente

-m --strip-mean
tira a imagem média da série

-f --save-features =
salvar imagem característica

-p --strip-periódico
retire apenas o componente periódico

-x --max-ica-iterations = 0
max ICA solver iterations max iterações do solver ICA

-n --ica-normalizar
ica_normalize imagens de recursos

--all-features =
salvar todas as imagens de recursos em

-L --LV-crop-amp = 0
Amplificação da máscara de corte LV, 0.0 = não corta amplificação da máscara de corte LV, 0.0
= não cortar

-a --componentes automáticos
estimativa automática do número de componentes com base na correlação. Implica
-m e -n (Experimental)

Ajuda & Info
-V --verbose = aviso
detalhamento de saída, mensagens de impressão de determinado nível e prioridades mais altas.
As prioridades com suporte começando no nível mais baixo são:
info - Mensagens de baixo nível
traçar - Rastreamento de chamada de função
falhar - Reportar falhas de teste
aviso - Avisos
erro - Reportar erros
depurar - Saída de depuração
mensagem - Mensagens normais
fatal - Reportar apenas erros fatais

--direito autoral
imprimir informações de direitos autorais

-h --ajuda
imprima esta ajuda

-? --uso
imprimir uma pequena ajuda

--versão
imprima o número da versão e saia

Tratamento
--threads = -1
Número máximo de threads a serem usados ​​para processamento, este número deve ser menor
ou igual ao número de núcleos de processador lógico na máquina. (-1:
estimativa automática). Número máximo de threads a serem usados ​​para processamento,
o número deve ser menor ou igual ao número de núcleos de processador lógico em
a máquina. (-1: estimativa automática).

PLUGINS: 2dimage / io

bmp Suporte para entrada / saída de imagem BMP 2D

Extensões de arquivo reconhecidas: .BMP, .bmp

Tipos de elementos suportados:
dados binários, 8 bits sem sinal, 16 bits sem sinal

conjunto de dados IO virtual de e para o pool de dados interno

Extensões de arquivo reconhecidas:. @

dicom Io de imagem 2D para DICOM

Extensões de arquivo reconhecidas: .DCM, .dcm

Tipos de elementos suportados:
16 bits com sinal, 16 bits sem sinal

exr um plugin 2dimage io para imagens OpenEXR

Extensões de arquivo reconhecidas: .EXR, .exr

Tipos de elementos suportados:
32 bits sem sinal, ponto flutuante de 32 bits

jpg um plugin 2dimage io para imagens jpeg em escala de cinza

Extensões de arquivo reconhecidas: .JPEG, .JPG, .jpeg, .jpg

Tipos de elementos suportados:
8 bits sem sinal

png um plugin 2dimage io para imagens png

Extensões de arquivo reconhecidas: .PNG, .png

Tipos de elementos suportados:
dados binários, 8 bits sem sinal, 16 bits sem sinal

cru Suporte para saída de imagem 2D RAW

Extensões de arquivo reconhecidas: .RAW, .raw

Tipos de elementos suportados:
dados binários, assinados 8 bits, não assinados 8 bits, assinados 16 bits, não assinados 16 bits,
32 bits assinados, 32 bits não assinados, ponto flutuante 32 bits, ponto flutuante 64
bocado

tif Suporte para entrada / saída de imagem TIFF 2D

Extensões de arquivo reconhecidas: .TIF, .TIFF, .tif, .tiff

Tipos de elementos suportados:
dados binários, 8 bits sem sinal, 16 bits sem sinal, 32 bits sem sinal

vista um plugin 2dimage io para imagens vista

Extensões de arquivo reconhecidas: .V, .VISTA, .v, .vista

Tipos de elementos suportados:
dados binários, assinados 8 bits, não assinados 8 bits, assinados 16 bits, não assinados 16 bits,
32 bits assinados, 32 bits não assinados, ponto flutuante 32 bits, ponto flutuante 64
bocado

EXEMPLO

Avalie as referências sintéticas das imagens imageXXXX.exr e salve-as em refXXXX.exr
usando cinco componentes independentes, significa remover, normalizar e pular 2 imagens.

mia-2dmyocard-ica -i imageXXXX.exr -o ref -k 2 -C 5 -m -n

AUTOR (es)

Gert Wollny

DIREITOS AUTORAIS

Este software é protegido por Copyright (c) 1999-2015 Leipzig, Alemanha e Madrid, Espanha. Vêm
com ABSOLUTAMENTE NENHUMA GARANTIA e você pode redistribuí-lo sob os termos do GNU
LICENÇA PÚBLICA GERAL Versão 3 (ou posterior). Para obter mais informações, execute o programa com o
opção '--copyright'.

Use mia-2dmyocard-ica online usando serviços onworks.net