mia-2dsegseriesstats - On-line na nuvem

PROGRAMA:

NOME

mia-2dsegseriesstats - Avalie curvas de tempo-intensidade em regiões mascaradas de séries de imagens.

SINOPSE

mia-2dsegseriesstats -o -g [opções]

DESCRIÇÃO

mia-2dsegseriesstats Este programa é usado para avaliar várias curvas de tempo-intensidade ao longo de um
série de imagens fornecidas por um conjunto de segmentação. Especificamente, o programa é adaptado para
avaliar intensidades médias e variações de cortes do miocárdio do ventrículo esquerdo. O
conjunto de segmentação deve conter as segmentações para todas as fatias que serão acessadas
durante a avaliação.

OPÇÕES

-o --original=(entrada, obrigatório); corda
conjunto de segmentação original

-g --registered=(entrada, obrigatório); corda
conjunto de segmentação registrado

-k --skip = 2
imagens para pular no início da série, se (k <0) usar o pico RV do
conjunto registrado se setimages pular no início da série, se (k <0)
use o pico RV do conjunto registrado, se definido

-r --referência=-1
quadro de referência para extração automática de curvas. Valores negativos podem ser usados
para indicar valores específicos (se fornecidos no conjunto de segmentação):
-3: Meio da série
-2: referência preferencial
-1: Pico do VE se alguma das opções acima não estiver disponível ou o valor for < -3,
use o último quadro do quadro de referência da série para curva automática
Extração. Valores negativos podem ser usados ​​para indicar valores específicos (se
dado no conjunto de segmentação):
-3: Meio da série
-2: referência preferencial
-1: Pico do VE se alguma das opções acima não estiver disponível ou o valor for < -3,
use o último quadro da série.

-c --curvas=(saída); corda
curvas de valor médio da região, cada arquivo de saída compreende uma tabela em
formato de texto simples que contém três colunas para cada seção do LV
miocárdio: A primeira coluna contém os valores obtidos usando o
segmentação original da referência em todas as imagens da série original,
a segunda coluna contém os valores obtidos pelos cadastrados
segmentação da referência em todas as imagens da série cadastrada, e
a terceira coluna contém os valores obtidos usando as segmentações de
cada fatia nas imagens originais.

-v --varcurves=(saída); corda
valores de variação da região, mesmo formato descrito acima.

-n --nseções = 0
número de seções a serem usadas, 0 = usar como segmentado, caso contrário, o LV
o miocárdio é dividido em n seções que envolvem ângulos iguais começando em
o ponto de inserção do ventrículo direito movendo-se no sentido horário usando o centro do VE como
ponto angular.número de seções a serem usadas, 0 = usar como segmentado, caso contrário
Caso contrário, o miocárdio do VE é dividido em n seções que envolvem partes iguais
ângulos começando no ponto de inserção do ventrículo direito movendo-se no sentido horário
usando o centro do VE como ponto angular.

Ajuda & Info
-V --verbose = aviso
detalhamento de saída, mensagens de impressão de determinado nível e prioridades mais altas.
As prioridades com suporte começando no nível mais baixo são:
info - Mensagens de baixo nível
traçar - Rastreamento de chamada de função
falhar - Reportar falhas de teste
aviso - Avisos
erro - Reportar erros
depurar - Saída de depuração
mensagem - Mensagens normais
fatal - Reportar apenas erros fatais

--direito autoral
imprimir informações de direitos autorais

-h --ajuda
imprima esta ajuda

-? --uso
imprimir uma pequena ajuda

--versão
imprima o número da versão e saia

Tratamento
--threads = -1
Número máximo de threads a serem usados ​​para processamento, este número deve ser menor
ou igual ao número de núcleos de processador lógico na máquina. (-1:
estimativa automática). Número máximo de threads a serem usados ​​para processamento,
o número deve ser menor ou igual ao número de núcleos de processador lógico em
a máquina. (-1: estimativa automática).

EXEMPLO

Avalie as duas curvas digitadas para 12 seções dos conjuntos de segmentação orig.set e reg.set
pulando os 2 primeiros quadros. A saída será gravada em curves.txt e varcurves.txt
respectivamente.

mia-2dsegseriesstats -i org.set -g reg.set -c curvas.txt -v varcurves.txt -n 12 -k 2

AUTOR (es)

Gert Wollny

DIREITOS AUTORAIS

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opção '--copyright'.

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