mia-3dfluid - Online na nuvem

PROGRAMA:

NOME

mia-3dfluid - Registro 3D dinâmico de fluido

SINOPSE

mia-3dfluido -i -r -o [opções]

DESCRIÇÃO

mia-3dfluido Este programa é usado para registro não rígido com base na dinâmica de fluidos como
descrito em: Wollny, G. e Kruggel, F., 'Computational cost of non-rigid registration
algoritmos baseados em dinâmica de fluidos ', IEEE Transactions on Medical Imaging, 11(8), pág.
946-952, 2002, doi: 10.1109 / TMI.2002.803113. Ele usa SSD como o único registro
critério.

OPÇÕES

Arquivo-IO
-i --in-image = (entrada, obrigatório); io
imagem de entrada Para os tipos de arquivo suportados, consulte PLUGINS: 3dimage / io

-r --ref-image = (entrada, obrigatório); io
imagem de referência Para os tipos de arquivo suportados, consulte PLUGINS: 3dimage / io

-o --out -formation = (saída, obrigatório); io
transformação de saída que compreende o campo de transformação de registro Para
tipos de arquivo suportados, consulte PLUGINS: 3dtransform / io

-d --out-image = (saída); io
salvar imagem deformada Para os tipos de arquivo suportados, consulte PLUGINS: 3dimage / io

Ajuda & Info
-V --verbose = aviso
detalhamento de saída, mensagens de impressão de determinado nível e prioridades mais altas.
As prioridades com suporte começando no nível mais baixo são:
info - Mensagens de baixo nível
traçar - Rastreamento de chamada de função
falhar - Reportar falhas de teste
aviso - Avisos
erro - Reportar erros
depurar - Saída de depuração
mensagem - Mensagens normais
fatal - Reportar apenas erros fatais

--direito autoral
imprimir informações de direitos autorais

-h --ajuda
imprima esta ajuda

-? --uso
imprimir uma pequena ajuda

--versão
imprima o número da versão e saia

Tratamento
--threads = -1
Número máximo de threads a serem usados ​​para processamento, este número deve ser menor
ou igual ao número de núcleos de processador lógico na máquina. (-1:
estimativa automática). Número máximo de threads a serem usados ​​para processamento,
o número deve ser menor ou igual ao número de núcleos de processador lógico em
a máquina. (-1: estimativa automática).

Registo parâmetros
--disable-multigrid
desabilitar o processamento multi-grade

--disable-fullres
desabilite o processamento na imagem de resolução total

--lambda = 1
constante elástica constante elástica

--mu = 1
constante elástica constante elástica

-s --start-size = 16
tamanho inicial multigrided; tamanho inicial multigrided

-m --method = sora
método para resolver PDE
sor - superelaxamento sucessivo
sora - Relexação de Gauss Southwell

--step = 0.8
Tamanho inicial da etapa Tamanho inicial da etapa

-p --interpolator = bspline: d = 3
interpolador de imagem kernelimage kernel do interpolador Para plugins suportados
veja PLUGINS: 1d / splinekernel

--relax = 1
fator de superelaxação por método soroverrelaxation fator por método sor

--maxiter = 10
iterações máximas; iterações máximas

--epsilon = 0.01
condição de truncamento condição de truncamento

--matter = 4
intensidade acima da qual a matéria real é assumida intensidade (experimental) acima
qual matéria real é assumida (experimental)

PLUGINS: 1d / splinekernel

spline Criação de kernel B-spline, os parâmetros suportados são:

d = 3; int em [0, 5]
Grau de spline.

mães Criação de kernel OMoms-spline, os parâmetros suportados são:

d = 3; int em [3, 3]
Grau de spline.

PLUGINS: 3dimage / io

analisar Analisar imagem 7.5

Extensões de arquivo reconhecidas: .HDR, .hdr

Tipos de elementos suportados:
8 bits não assinados, 16 bits assinados, 32 bits assinados, ponto flutuante 32 bits,
ponto flutuante de 64 bits

conjunto de dados IO virtual de e para o pool de dados interno

Extensões de arquivo reconhecidas:. @

dicom Série de imagens Dicom como 3D

Extensões de arquivo reconhecidas: .DCM, .dcm

Tipos de elementos suportados:
16 bits com sinal, 16 bits sem sinal

hdf5 IO de imagem 5D HDF3

Extensões de arquivo reconhecidas: .H5, .h5

Tipos de elementos suportados:
dados binários, assinados 8 bits, não assinados 8 bits, assinados 16 bits, não assinados 16 bits,
32 bits assinados, 32 bits não assinados, 64 bits assinados, 64 bits não assinados, flutuante
ponto de 32 bits, ponto flutuante de 64 bits

ínria Imagem INRIA

Extensões de arquivo reconhecidas: .INR, .inr

Tipos de elementos suportados:
8 bits assinados, 8 bits não assinados, 16 bits assinados, 16 bits não assinados, 32 assinados
bit, 32 bits não assinados, ponto flutuante 32 bits, ponto flutuante 64 bits

mhd MetaIO 3D IO de imagem usando a implementação VTK (experimental).

Extensões de arquivo reconhecidas: .MHA, .MHD, .mha, .mhd

Tipos de elementos suportados:
8 bits assinados, 8 bits não assinados, 16 bits assinados, 16 bits não assinados, 32 assinados
bit, 32 bits não assinados, ponto flutuante 32 bits, ponto flutuante 64 bits

bacana NIFTI-1 imagem 3D IO

Extensões de arquivo reconhecidas: .NII, .nii

Tipos de elementos suportados:
8 bits assinados, 8 bits não assinados, 16 bits assinados, 16 bits não assinados, 32 assinados
bit, 32 bits não assinados, 64 bits assinados, 64 bits não assinados, ponto flutuante 32
bit, ponto flutuante 64 bits

vff Formato raster VFF Sun

Extensões de arquivo reconhecidas: .VFF, .vff

Tipos de elementos suportados:
8 bits sem sinal, 16 bits com sinal

vista Visualização 3D

Extensões de arquivo reconhecidas: .V, .VISTA, .v, .vista

Tipos de elementos suportados:
dados binários, assinados 8 bits, não assinados 8 bits, assinados 16 bits, não assinados 16 bits,
32 bits assinados, 32 bits não assinados, ponto flutuante 32 bits, ponto flutuante 64
bocado

vti Entrada e saída VTK-XML de imagem 3D (experimental).

Extensões de arquivo reconhecidas: .VTI, .vti

Tipos de elementos suportados:
8 bits assinados, 8 bits não assinados, 16 bits assinados, 16 bits não assinados, 32 assinados
bit, 32 bits não assinados, ponto flutuante 32 bits, ponto flutuante 64 bits

vtk Entrada e saída de legado de imagem 3D VTK (experimental).

Extensões de arquivo reconhecidas: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage

Tipos de elementos suportados:
dados binários, assinados 8 bits, não assinados 8 bits, assinados 16 bits, não assinados 16 bits,
32 bits assinados, 32 bits não assinados, ponto flutuante 32 bits, ponto flutuante 64
bocado

PLUGINS: 3dtransform / io

与奥巴马再次尝试的欲望几乎没有。 如果它仍然是一部分，但利比亚的最后残余后消失。 俄罗斯，但是，燃烧物从自己的屈辱往年，没有尝试在分美国建设性谈判。 IO serializado binário (não portátil) de transformações 3D

Extensões de arquivo reconhecidas: .bbs

conjunto de dados IO virtual de e para o pool de dados interno

Extensões de arquivo reconhecidas:. @

vista Armazenamento Vista de transformações 3D

Extensões de arquivo reconhecidas: .v, .v3dt

xml XML serializado IO de transformações 3D

Extensões de arquivo reconhecidas: .x3dt

EXEMPLO

Registre a imagem test.v na imagem ref.v e escreva o campo vetorial de deformação regfield.v.
Inicie o registro no menor tamanho acima de 16 pixels.

mia-3dfluid -i teste.v -r ref.v -o regfield.v -s 16

AUTOR (es)

Gert Wollny

DIREITOS AUTORAIS

Este software é protegido por Copyright (c) 1999-2015 Leipzig, Alemanha e Madrid, Espanha. Vêm
com ABSOLUTAMENTE NENHUMA GARANTIA e você pode redistribuí-lo sob os termos do GNU
LICENÇA PÚBLICA GERAL Versão 3 (ou posterior). Para obter mais informações, execute o programa com o
opção '--copyright'.

Use mia-3dfluid online usando serviços onworks.net