Este é o aplicativo Linux denominado Autoprime para rodar em Linux online, cuja versão mais recente pode ser baixada como autoprime.2.1.tar.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado Autoprime para rodar em Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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Autoprime para rodar em Linux online
DESCRIÇÃO
O AutoPrime permite criar primers rapidamente para medição de PCR em tempo real da expressão eucariótica.Ao conectar-se ao banco de dados EnsEMBL, as informações da estrutura do gene são usadas para encontrar primers que ultrapassam as fronteiras do exon. Desta forma, apenas sequências expressas são capturadas. Além disso, o mispriming em regiões repetitivas pode ser evitado usando informações do RepBase.
Recursos
- Projeto de primer automatizado
- Controle de qualidade por meio de configurações detalhadas
- Usando fontes conhecidas: Primer3, EnsEMBL, RepBase
- Criando suas cartilhas desde 2003
- Site funcionando como um serviço
- Código Perl disponível para execução local
Público
Ciência / pesquisa, usuários finais avançados
Interface com o usuário
Baseado na Web, linha de comando
Linguagem de Programação
Perl
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/autoprime/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
