Este é o aplicativo Linux chamado FASTQSim, cuja versão mais recente pode ser baixada como FASTQsim_v2.0.tgz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado FASTQSim com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
FASTQSim
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DESCRIÇÃO
FASTQSim é uma ferramenta que fornece a funcionalidade dupla de caracterização de conjunto de dados de sequenciamento de última geração e geração de dados metagenômicos.
FASTQSim é independente de plataforma de sequenciamento e calcula distribuições de comprimento de leitura, pontuações de qualidade, taxas de indel, taxas de mutação de ponto único, tamanho de indel e estatísticas semelhantes para qualquer sequenciamento
plataforma. Para criar conjuntos de dados de treinamento ou teste, FASTQSim tem a capacidade de converter sequências de destino em leituras in silico com correspondência
perfis de erro.
O FASTQsim permite ao usuário simular conjuntos de dados de leitura individuais que podem ser usados como cenários de teste padronizados para o planejamento de projetos de sequenciamento ou para benchmarking de software metagenômico. Nesse sentido, os conjuntos de dados in silico gerados com a ferramenta FASTQsim possuem várias vantagens sobre os conjuntos de dados naturais: eles são independentes de plataforma de sequenciamento, extremamente bem caracterizados e menos caros de gerar.
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/fastqsim/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
