Este é o aplicativo Linux denominado GenOO-HTS para rodar em Linux online, cuja versão mais recente pode ser baixada como genoo-code-2013_04_18.tar.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado GenOO-HTS para rodar em Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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GenOO-HTS para rodar em Linux online
DESCRIÇÃO
GenOO-HTS [jee-noo] é um código-fonte aberto; framework Perl orientado a objetos desenvolvido especificamente para o projeto de ferramentas de análise de High Throughput Sequencing (HTS). O objetivo principal do GenOO-HTS é tornar as análises HTS simples fáceis e as análises complicadas possíveis. GenOO-HTS modela entidades biológicas em objetos Perl e fornece atributos e métodos relevantes que permitem a manipulação de dados de sequenciamento de alto rendimento. Usar o GenOO-HTS como um módulo de desenvolvimento central reduz a sobrecarga e a complexidade do gerenciamento dos dados e das entidades biológicas disponíveis. GenOO-HTS foi projetado para ser flexível, facilmente extensível com estrutura modular e requisitos mínimos para ferramentas externas e bibliotecas.Recursos
- Organize entidades biológicas como objetos perl (regiões genômicas, genes, transcritos, íntrons / exons, etc)
- Organizar entidades de sequenciamento como objetos / atributos perl (leituras de sequenciamento, alinhamentos, etc)
- Facilite o I / O de formatos de arquivo amplamente usados (SAM, BED, FASTA, FASTQ)
- Seja consistente e facilmente extensível
Público
Ciência / Pesquisa, Desenvolvedores
Linguagem de Programação
Perl
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/genoo/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
