Este é o aplicativo Linux denominado software GMATA para marcador SSR Genomic, cuja versão mais recente pode ser baixada como GMATAv2.2.jar. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado software GMATA para marcador SSR Genomic com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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Software GMATA para marcador SSR genômico
DESCRIÇÃO
O que é o software GMATA v21
A análise de microssatélites de todo o genoma para a aplicação (GMATA) é um software para análises de repetições de sequência simples (SSR) e design de marcador de SSR e mapeamento em qualquer sequência de DNA. Possui as seguintes funções:
1. Mineração SSR;
2. Análise estatística e plotagem;
3. Visualização gráfica de loci SSR;
4. Desenho do marcador;
5. Mapeamento eletrônico e investigação de transferibilidade de marcadores.
GMATA é preciso, sensível e rápido. Ele foi projetado para processar grandes conjuntos de dados de sequência genômica, especialmente grandes sequências de genoma completo. Em teoria, genomas de qualquer tamanho podem ser analisados pelo GMATA facilmente. O software GMATA funciona em servidor, desktop ou mesmo laptop, podendo rodar em interface gráfica com apenas cliques ou rodar em linha de comando ou em pipeline automatizado. Também é multiplataforma e suporta Unix / Linux, Win e Mac. Os resultados do software GMATA podem ser exibidos graficamente diretamente com genoma ou características genéticas no Gbrowser e facilmente integrados com qualquer banco de dados genômico.
Funcionalidades
- Mineração SSR mais rápida e precisa em qualquer sequência grande
- Análise estatística completa e plotagem
- Loci SSR e gráfico de marcador exibido no Gbrowser com recursos de genoma
- Projeto de marcador SSR específico e PCR simulado
- Mapeamento eletrônico e investigação de transferibilidade de marcador
- também disponível em https://github.com/XuewenWangUGA/GMATA.git
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/gmata/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
