Este é o aplicativo Linux chamado Kinannote para rodar em Linux online, cuja versão mais recente pode ser baixada como Kinannote_1.0.tar. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado Kinannote para rodar em Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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Kinannote para rodar em Linux online
DESCRIÇÃO
Kinannote identifica e classifica proteínas quinases em um arquivo fasta fornecido pelo usuário usando um HMM derivado de proteína quinases serina / treonina, uma matriz de pontuação específica de posição derivada de HMM e comparação com uma versão local do banco de dados de quinase curado de kinase. com. Se o usuário inserir um proteoma completo, os módulos adicionais avaliam a integridade do quinomo e o colocam no contexto com os quinomos de referência. O Kinannote é executado em uma linha de comando unix e depende das instalações locais do hmmer 2 e do Blast 2.24.Citando Kinannote:
Kinannote, um programa de computador para identificar e classificar os membros da superfamília da proteína quinase eucariótica
Jonathan M. Goldberg; Allison Griggs; Janete L. Smith; Brian Haas; Jennifer Wortman; Qiandong Zeng
Bioinformatics 2013; doi: 10.1093 / bioinformática / btt419
http: http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/29/19/2387.full
pdf: http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/29/19/2387.full.pdf+html
Público
Ciência / Pesquisa
Linguagem de Programação
Perl
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/kinannote/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
