Este é o aplicativo Linux chamado lr2rmats para rodar no Linux online, cuja versão mais recente pode ser baixada como lr2rmats-v0.1-alpha.tar.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado lr2rmats para ser executado no Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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lr2rmats para rodar em Linux online
DESCRIÇÃO
lr2rmats é um pipeline leve baseado em Snakemake, projetado para utilizar dados de RNA-seq de leitura longa e de segunda geração de leitura curta para gerar um arquivo de anotação de gene aprimorado. O arquivo de anotação recém-gerado pode ser fornecido à rMATS para análise de splicing alternativo diferencial.Mais informações podem ser encontradas em https://sourceforge.net/p/lr2rmats/wiki/Home/
Recursos
- Longa leitura
- RNA-seq
- Emenda alternativa
- Biociências do Pacífico
- Tecnologias Oxford Nanopore
Público
Ciência / Pesquisa
Interface com o usuário
Linha de comando
Linguagem de Programação
Shell Unix, Python, C
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/lr2rmats/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
