Este é o aplicativo Linux chamado ParamIT para rodar no Linux online, cuja versão mais recente pode ser baixada como ParamITPack-1.0.tar.bz2. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado ParamIT para rodar em Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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ParamIT para rodar em Linux online
DESCRIÇÃO
ParamIT é um kit de ferramentas que auxilia no desenvolvimento da parametrização do campo de força mecânica molecular de moléculas pequenas, semelhantes a arrasto, dentro do protocolo de campo de força geral CHARMM (CGenFF). O kit de ferramentas desenvolvido ajuda os pesquisadores das seguintes maneiras: 1) automatizando a criação de vários arquivos de entrada para programas de mecânica quântica e molecular, 2) automatizando a análise de saída e 3) substituindo o uso de programas completos de MM por um especializado mais rápido. As ferramentas desenvolvidas incluem: 1) gerador de complexos molécula-água com interface gráfica de usuário (GUI), 2) análise de frequência semiautomática usando matriz de distribuição de energia potencial simbólica e comparação de coordenadas internas otimizadas, 3) GUI para ajuste de carga com três modos : manual, amostragem de Monte-Carlo ou força bruta e 4) GUI para ajuste de termos diédricos. O uso dessas ferramentas diminui o esforço de trabalho, diminui os erros de entrada manual e reduz o tempo necessário para esforços de parametrização de MM precisos.Público
Ciência / Pesquisa
Interface com o usuário
Linha de comando, Tk
Linguagem de Programação
C, Pitão
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/paramit/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
