Este é o aplicativo Linux denominado PolyCTLDesigner para executar no Linux online, cuja versão mais recente pode ser baixada como dist_PolyCTLDesigner.0.3.a.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado PolyCTLDesigner para rodar em Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
PolyCTLDesigner para rodar em Linux online
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DESCRIÇÃO
Dados os peptídeos (epítopos de células T), PolyCTLDesigner seleciona sequências de flanqueamento para otimizar a ligação de TAP e une oligopeptídeos resultantes em um poliepítopo de uma forma que fornece liberação eficiente de epítopos potenciais por processamento proteassomal e / ou imunoproteasomal e minimizando o número de epítopos juncionais. Para a construção de poliepítopos, o PolyCTLDesigner utiliza padrões de aminoácidos conhecidos de clivagem de proteassoma e especificidade de ligação a TAP. O PolyCTLDesigner também é capaz de escolher peptídeos antigênicos cobrindo o repertório HLA selecionado com a taxa de redundância desejada. Dadas as sequências de antígenos, o PolyCTLDesigner também é capaz de selecionar epítopos T auxiliares. Para prever epítopos de células T, ele usa TEpredict.Público
Ciência / Pesquisa
Linguagem de Programação
Python
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/polyctldesigner/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
