Este é o aplicativo Linux denominado SpiKeDeteKt para ser executado no Linux online, cuja versão mais recente pode ser baixada como SpikeDetekt0.1.2.tar.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado SpiKeDeteKt para ser executado no Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SpiKeDeteKt para rodar em Linux online
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DESCRIÇÃO
Este é um programa de detecção automática de picos que leva em consideração a geometria da sonda e produz um arquivo .mask para ser usado com a nova versão mascarada do KlustaKwik.Recomendamos que você use Python 2.6 ou 2.7, por exemplo, uma versão acadêmica gratuita pode ser obtida no Entthought Python.
Os arquivos de entrada para SpiKeDeteKt são:
.dat (arquivo de dados brutos)
.probe (arquivo de teste, descrito abaixo - construído pelo usuário)
parameters.py (opcional - caso contrário, usa defaultparameters.py)
SpiKeDeteKt gera os seguintes arquivos:
.fet.n (arquivo de recurso)
.mask.n (necessário para usar o novo (mascarado) KlustaKwik)
.clu.n (um arquivo de pista trivial onde tudo é colocado em um único cluster)
.fmask.n (teste - máscaras flutuantes em vez de binárias, estamos usando isso para testar o KlustaKwik mascarado)
.spk.n (arquivo spike)
.upsk.n (forma de onda de pico não filtrado)
.res.n (lista de tempos de pico)
.xml (um arquivo xml com todos os parâmetros que podem ser usados posteriormente pelo neuroscope ou klusters)
.fil (dados filtrados highpass)
.h5 (
Público
Ciência / Pesquisa
Linguagem de Programação
Python
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/spikedetekt/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
