Este é o aplicativo Linux denominado StatAlign para execução no Linux online, cuja versão mais recente pode ser baixada como StatAlign-v2.1.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado StatAlign para rodar em Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
StatAlign para rodar em Linux online
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DESCRIÇÃO
StatAlign é um pacote de software extensível para análise bayesiana de sequências de proteínas, DNA e RNA. Alinhamentos múltiplos, árvores filogenéticas e parâmetros evolutivos são co-estimados em uma estrutura de Markov Chain Monte Carlo, permitindo uma medição confiável da precisão dos resultados.Essa abordagem elimina artefatos comuns dos quais os métodos tradicionais sofrem, ao custo de um tempo computacional maior. Esses artefatos incluem a dependência da filogenia construída em um único alinhamento (provavelmente subótimo) e inclinação para a árvore-guia na qual o alinhamento depende.
Os modelos por trás da análise permitem a comparação de sequências evolutivamente distantes: o modelo de inserção-exclusão TKF92 pode ser acoplado a um modelo de substituição arbitrário. Uma ampla gama de modelos para dados de nucleotídeos e aminoácidos está incluída no pacote e o sistema de gerenciamento de plug-in garante que novos modelos possam ser facilmente adicionados.
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/statalign/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.