Este é o aplicativo Linux chamado VCF Explorer para rodar em Linux online, cuja versão mais recente pode ser baixada como VCFExplorer.tar.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado VCF Explorer para rodar em Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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VCF Explorer para rodar em Linux online
DESCRIÇÃO
s tecnologias de alto rendimento e custo decrescente levaram a uma série de projetos de sequenciamento que consistem em milhares de genomas inteiros. A mudança de paradigma do exoma para o genoma completo traz um aumento significativo no tamanho dos arquivos de saída. A maioria das ferramentas existentes que são desenvolvidas para analisar arquivos de exoma não são adequadas para grandes arquivos VCF produzidos por estudos de genoma completo. Neste trabalho, apresentamos o VCF-Explorer, um software de análise de variantes capaz de lidar com arquivos grandes. O gerenciamento eficiente da memória do programa e a eliminação da etapa de análise preliminar permitem realizar a análise em computadores comuns. O VCF-Explorer apresenta um ambiente fácil de usar onde vários tipos de consultas para a anotação e os exemplos podem ser definidos. O VCF-Explorer pode ser executado em diferentes ambientes e plataformas computacionais, desde um laptop padrão a um servidor avançado.Recursos
- Um ambiente fácil de usar
- Gerenciamento de memória eficiente
- Processamento de arquivo VCF grande (todo o genoma)
- Operável em computador pessoal com recursos computacionais limitados
Interface com o usuário
Qt
Linguagem de Programação
C ++, C
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/vcfexplorer/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
