Aceasta este comanda bp_nrdbp care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
bp_nrdb.PLS - un script pentru a emula nrdb-ul lui Warren Gish, face o bază de date unică de secvențe din
un set de baze de date de intrare
REZUMAT
Utilizare:
bp_nrdb.PLS [opțiuni] fișier1 fișier2 fișier3
Utilizare alternativă
bp_nrdb.PLS -p [opțiuni] fișier1 id1 fișier2 id2 fișier3 id3
DESCRIERE
Acest script va crea o bază de date unică de secvențe (cvasi-nonredundant). Opțiunile
sunt:
-o nume de fișier - numele fișierului în care este scris db (STDOUT în mod implicit)
-un nume de fișier - numele de fișier la care să se atașeze db-ul
-l# - lungimea secvenței minimă necesară
-i - nu verificați dacă există duplicate
-n# - numărul maxim de descrieri de raportat per secv
-d# - delimitator de utilizat între descrierile consecutive
-p - folosește prefixele id-ului bazei de date din linia de comandă
Utilizați bp_nrdbp online folosind serviciile onworks.net
