Acesta este complexul de comenzi care poate fi rulat în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
complex - Găsiți complexitatea lingvistică în secvențele de nucleotide
REZUMAT
complex -secvenţă seqall -lwin întreg -Etapa întreg -jmin întreg -jmax întreg
-omnia comutare -sim întreg -frecventa boolean -imprimare boolean -outfile outfile
-ujtablefile outfile -outseq seqoutall
complex -Ajutor
DESCRIERE
complex este un program de linie de comandă de la EMBOSS („The European Molecular Biology Open
Suita de software”). Face parte din grupul (grupurile) de comandă „Nucleic:Composition”.
OPŢIUNI
Intrare secțiune
-secvenţă seqall
-lwin întreg
Valoare implicită: 100
-Etapa întreg
Deplasarea ferestrei peste secvență Valoare implicită: 5
-jmin întreg
Valoare implicită: 4
-jmax întreg
Valoare implicită: 6
Avansat secțiune
-omnia comutare
Calculați pe un set de secvențe Valoare implicită: N
-sim întreg
Calculați complexitatea lingvistică prin comparație cu un număr de simulări având
o distribuție uniformă a bazelor
-frecventa boolean
Executați simularea unei secvențe pe baza frecvenței de bază a originalului
secvență Valoare implicită: N
producție secțiune
-imprimare boolean
Generați un fișier numit UjTable care conține valorile lui Uj pentru fiecare cuvânt j din real
secvență(e) și în orice secvențe simulate Valoare implicită: N
-outfile outfile
-ujtablefile outfile
Valoare implicită: complex.ujtable
-outseq seqoutall
Utilizați online complex folosind serviciile onworks.net