Aceasta este comanda cpgreporte care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
cpgreport - Identificați și raportați regiunile bogate în CpG din secvența(ele) de nucleotide
REZUMAT
cpgreport -secvenţă seqall -Scor întreg -outfile outfile -înfrângerea featout
cpgreport -Ajutor
DESCRIERE
cpgreport este un program de linie de comandă de la EMBOSS („The European Molecular Biology Open
Suita de software”). Face parte din grupul (grupurile) de comandă „Nucleic:CpG Islands”.
OPŢIUNI
Intrare secțiune
-secvenţă seqall
Necesar secțiune
-Scor întreg
Aceasta stabilește scorul pentru fiecare secvență CG găsită. O valoare de 17 este mai sensibilă, dar
28 a fost, de asemenea, folosit cu oarecare succes. Valoare implicită: 17
producție secțiune
-outfile outfile
-înfrângerea featout
Fișier pentru caracteristicile de ieșire
Utilizați cpgreporte online folosind serviciile onworks.net