Aceasta este comanda fdnadiste care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
fdnadist - Secvență de acid nucleic Program Matrice de distanță
REZUMAT
fdnadist -secvenţă seqsetall -metodă listă -gamă listă -ncategorii întreg -rată mulțime
-categorii proprietăţi [-greutăți proprietăţi] -gamacoeficient pluti
-invarfrac pluti -trattio pluti -frecvențe de la comutare -frecventa de baza mulțime
[-inferior boolean] [- lizibil de om boolean] -outfile outfile [-printdate boolean]
[-progres boolean]
fdnadist -Ajutor
DESCRIERE
fdnadist este un program de linie de comandă de la EMBOSS („The European Molecular Biology Open
Suita de software”). Face parte din grupul (grupurile) de comandă „Filogenie: secvență moleculară”.
OPŢIUNI
Intrare secțiune
-secvenţă seqsetall
Fișier care conține una sau mai multe aliniamente de secvență
-metodă listă
Valoare implicită: model de distanță F84
-gamă listă
Valoare implicită: nu sunt utilizați parametri de distribuție
-ncategorii întreg
Valoare implicită: 1
-rată mulțime
Valoare implicită: 1.0
-categorii proprietăţi
Dosarul categoriilor ratei de substituire
-greutăți proprietăţi
Suplimentar secțiune
-gamacoeficient pluti
Valoare implicită: 1
-invarfrac pluti
Valoare implicită: 0.0
-trattio pluti
Valoare implicită: 2.0
-frecvențe de la comutare
Valoarea implicită: Y
-frecventa de baza mulțime
Valoare implicită: 0.25 0.25 0.25 0.25
-inferior boolean
Valoarea implicită: N
- lizibil de om boolean
Valoare implicită: @($(metoda)==s?Y:N)
producție secțiune
-outfile outfile
-printdate boolean
Valoarea implicită: N
-progres boolean
Valoarea implicită: Y
Utilizați fdnadiste online folosind serviciile onworks.net