Aceasta este comanda fpromlke care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
fpromlk - Filogenia proteinelor după probabilitate maximă
REZUMAT
fpromlk -secvenţă seqsetall -intreefile copac [-ncategorii întreg] -rată mulțime
-categorii proprietăţi [-greutăți proprietăţi] -lungimi boolean [model listă]
[-gamă listă] -gamacoeficient pluti -ngammacat întreg -invarcoeficient pluti
-ninvarcat întreg -invarfrac pluti -nhmmcategories întreg -hmmrate mulțime
-hmmprobabilități mulțime -adjsite boolean -lambda pluti -njumble întreg
-samanta întreg -global boolean [-outgrno întreg] -outfile outfile [-păstrăv comutare]
-outtreefile outfile [-printdate boolean] [-progres boolean] [-amprenta copacului boolean]
[-hipstat boolean]
fpromlk -Ajutor
DESCRIERE
fpromlk este un program de linie de comandă de la EMBOSS („The European Molecular Biology Open
Suita de software”). Face parte din grupul (grupurile) de comandă „Filogenie: secvență moleculară”.
OPŢIUNI
Intrare secțiune
-secvenţă seqsetall
Fișier care conține una sau mai multe aliniamente de secvență
-intreefile copac
-ncategorii întreg
Valoare implicită: 1
-rată mulțime
-categorii proprietăţi
-greutăți proprietăţi
Suplimentar secțiune
-lungimi boolean
Valoarea implicită: N
model listă
Valoare implicită: Jones-Taylor-Thornton
-gamă listă
Valoare implicită: n
-gamacoeficient pluti
Valoare implicită: 1
-ngammacat întreg
Valoare implicită: 1
-invarcoeficient pluti
Valoare implicită: 1
-ninvarcat întreg
Valoare implicită: 1
-invarfrac pluti
Valoare implicită: 0.0
-nhmmcategories întreg
Valoare implicită: 1
-hmmrate mulțime
Valoare implicită: 1.0
-hmmprobabilități mulțime
Valoare implicită: 1.0
-adjsite boolean
Valoarea implicită: N
-lambda pluti
Valoare implicită: 1.0
-njumble întreg
-samanta întreg
Valoare implicită: 1
-global boolean
Valoarea implicită: N
-outgrno întreg
producție secțiune
-outfile outfile
-păstrăv comutare
Valoarea implicită: Y
-outtreefile outfile
-printdate boolean
Valoarea implicită: N
-progres boolean
Valoarea implicită: Y
-amprenta copacului boolean
Valoarea implicită: Y
-hipstat boolean
Valoarea implicită: N
Utilizați fpromlke online folosind serviciile onworks.net
