Aceasta este comanda hmm2fetch care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
hmm2fetch - preluați un HMM dintr-o bază de date HMM
REZUMAT
hmm2fetch [Opțiuni] Baza de date nume
DESCRIERE
hmm2fetch este un utilitar mic care preia un HMM numit nume dintr-o bază de date model HMMER
denumit Bază de date. într-un nou format și imprimă acel model la rezultatul standard. De exemplu,
hmm2fetch Pfam RRM preia modelul RRM (ARN recognition motiv) de la Pfam, dacă
variabila de mediu HMMERDB este setată la locația bazei de date Pfam. Cel recuperat
Fișierul HMM este scris în format HMMER 2 ASCII.
Baza de date trebuie să aibă asociat un fișier index GSI. Pentru a indexa o bază de date HMM, utilizați
program hmm2index.
OPŢIUNI
-h Imprimați un scurt ajutor; include numărul versiunii și rezumatul tuturor opțiunilor, inclusiv
opțiuni de experți.
-n interpret nume ca număr HMM în loc de nume. Numerotarea începe de la 0. Pentru
exemplu, pentru a prelua primul HMM dintr-o bază de date HMM numită prost, ai face
hmm2fetch -n 0 foo.
Utilizați hmm2fetch online folosind serviciile onworks.net
