Aceasta este comanda maf2anchors.pl care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
maf2anchors -- Convertește fișierele maf în seturi de ancore Murasaki
REZUMAT
maf2anchore
OPŢIUNI
--prefix=
utilizați ca prefix pentru numele fișierelor de ieșire (în caz contrar, folosește )
--rifturi=
permite până la rupturi.
--securi false
generați fișiere false cu lungimea secvenței și stub-uri de secvență pe baza datelor privind lungimea secvenței
în fișierul MAF
--încredere
aveți încredere în adnotarea comentariului adăugată de TBA pe a doua linie a fișierului (dacă este prezentă)
că listează arborele utilizat în aliniere și toate secvențele implicate. Valori implicite
la pe. utilizați --notrust pentru a nu avea încredere în etichetele TBA (din punct de vedere tehnic, aceste date nu fac parte din
specificația formatului de fișier și este doar înghesuit în comentarii pe care le produce TBA, dar
s-ar putea să nu fie prezente sau precise în toate fișierele MAF, așa că vă oferim opțiunea
nu ai incredere).
--fel
Sortați secvențele găsite după --trust (pentru a se potrivi cu rezultatul care ar avea
sa întâmplat cu --notrust).
Utilizați maf2anchors.pl online folosind serviciile onworks.net