mia-3dfluid - Online în cloud

PROGRAM:

NUME

mia-3dfluid - Înregistrare fluid dinamică 3D

REZUMAT

mia-3dfluid -i -r -o [Opțiuni]

DESCRIERE

mia-3dfluid Acest program este utilizat pentru înregistrarea non-rigidă bazată pe dinamica fluidelor ca
descris în: Wollny, G. și Kruggel, F., „Computational cost of non-rigid registration
algoritmi bazați pe dinamica fluidelor”, IEEE Transactions on Medical Imaging, 11(8), pp.
946-952, 2002, doi:10.1109/TMI.2002.803113. Folosește SSD ca unică înregistrare
criteriu.

OPŢIUNI

Fișier-IO
-i --in-image=(input, required); io
imagine de intrare Pentru tipurile de fișiere acceptate, consultați PLUGINS:3dimage/io

-r --ref-image=(intrare, necesar); io
imagine de referință Pentru tipurile de fișiere acceptate, consultați PLUGINS:3dimage/io

-o --out-transformation=(ieșire, necesar); io
transformare de ieşire cuprinzând câmpul de transformare de înregistrare Pentru
tipurile de fișiere acceptate vezi PLUGINS:3dtransform/io

-d --out-image=(ieșire); io
salvați imaginea deformată Pentru tipurile de fișiere acceptate, consultați PLUGINS:3dimage/io

Ajutor & Informație
-V --verbose=avertisment
verbozitatea rezultatelor, mesaje tipărite de nivel dat și priorități mai mari.
Prioritățile acceptate începând de la cel mai de jos nivel sunt:
info ‐ Mesaje de nivel scăzut
urmări ‐ Urmărirea apelului de funcție
eşua ‐ Raportați eșecurile testelor
de avertizare - Avertizări
eroare - Raportează erori
depana - Ieșire de depanare
mesaj ‐ Mesaje normale
fatal ‐ Raportați numai erori fatale

--drepturi de autor
tipăriți informații despre drepturile de autor

-h --ajutor
imprimați acest ajutor

-? --utilizare
imprimați un scurt ajutor

--versiune
tipăriți numărul versiunii și ieșiți

Prelucrare
--fire=-1
Numărul maxim de fire de execuție de utilizat pentru procesare, acest număr ar trebui să fie mai mic
sau egal cu numărul de nuclee de procesor logic din mașină. (-1:
estimare automată). Numărul maxim de fire de execuție de utilizat pentru procesare, Aceasta
numărul trebuie să fie mai mic sau egal cu numărul de nuclee de procesor logic în
Mașina. (-1: estimare automată).

Înscriere parametrii
--disable-multigrid
dezactivați procesarea cu mai multe rețele

--disable-fullres
dezactivați procesarea imaginii cu rezoluție completă

--lambda=1
constantă de elasticitate constantă de elasticitate

--mu=1
constantă de elasticitate constantă de elasticitate

-s --start-size=16
dimensiune inițială a mai multor rețele dimensiune inițială a rețelei multiple

-m --method=sora
metoda de rezolvare a PDE
SOR ‐ suprarelaxare succesivă
Șora ‐ Relaxare Gauss Southwell

--pas=0.8
Dimensiunea inițială a pasului

-p --interpolator=bspline:d=3
nucleu interpolator de imagini nucleu interpolator de imagini Pentru pluginuri acceptate
vezi PLUGINS:1d/splinekernel

--relax=1
factor de suprarelaxare vor method soroverrelaxation factor vor method sor

--maxiter=10
iterații maxime iterații maxime

--epsilon=0.01
condiție de trunchiere condiție de trunchiere

--materia=4
intensitate peste care materia reală se presupune (experimental)intensitate mai sus
care materie reală se presupune (experimental)

PLUG-URI: 1d/splinekernel

bspline Crearea nucleului B-spline, parametrii acceptați sunt:

d = 3; int în [0, 5]
Gradul spline.

omoms Crearea nucleului OMoms-spline, parametrii acceptați sunt:

d = 3; int în [3, 3]
Gradul spline.

PLUG-URI: 3dimage/io

analiza Analizați imaginea 7.5

Extensii de fișiere recunoscute: .HDR, .hdr

Tipuri de elemente acceptate:
8 biți nesemnat, 16 biți semnat, 32 de biți semnat, 32 de biți în virgulă mobilă,
virgulă mobilă 64 de biți

pool de date IO virtuală către și de la pool-ul de date intern

Extensii de fișiere recunoscute: .@

dicom Seria de imagini Dicom ca 3D

Extensii de fișiere recunoscute: .DCM, .dcm

Tipuri de elemente acceptate:
semnat pe 16 biți, nesemnat pe 16 biți

hdf5 HDF5 3D imagine IO

Extensii de fișiere recunoscute: .H5, .h5

Tipuri de elemente acceptate:
date binare, semnate pe 8 biți, nesemnate pe 8 biți, semnate pe 16 biți, nesemnate pe 16 biți,
semnat pe 32 de biți, nesemnat pe 32 de biți, semnat pe 64 de biți, nesemnat pe 64 de biți, flotant
punct 32 de biți, virgulă mobilă 64 de biți

inria Imaginea INRIA

Extensii de fișiere recunoscute: .INR, .inr

Tipuri de elemente acceptate:
semnat 8 biți, nesemnat 8 biți, semnat 16 biți, nesemnat 16 biți, semnat 32
bit, 32 de biți fără semn, virgulă mobilă 32 de biți, virgulă mobilă 64 de biți

mhd MetaIO 3D imagine IO folosind implementarea VTK (experimental).

Extensii de fișiere recunoscute: .MHA, .MHD, .mha, .mhd

Tipuri de elemente acceptate:
semnat 8 biți, nesemnat 8 biți, semnat 16 biți, nesemnat 16 biți, semnat 32
bit, 32 de biți fără semn, virgulă mobilă 32 de biți, virgulă mobilă 64 de biți

nifti Imagine 1D NIFTI-3 IO

Extensii de fișiere recunoscute: .NII, .nii

Tipuri de elemente acceptate:
semnat 8 biți, nesemnat 8 biți, semnat 16 biți, nesemnat 16 biți, semnat 32
bit, nesemnat pe 32 de biți, semnat pe 64 de biți, fără semn pe 64 de biți, virgulă mobilă 32
bit, virgulă mobilă 64 de biți

vff Format raster VFF Sun

Extensii de fișiere recunoscute: .VFF, .vff

Tipuri de elemente acceptate:
nesemnat pe 8 biți, semnat pe 16 biți

vista Vizualizare 3D

Extensii de fișiere recunoscute: .V, .VISTA, .v, .vista

Tipuri de elemente acceptate:
date binare, semnate pe 8 biți, nesemnate pe 8 biți, semnate pe 16 biți, nesemnate pe 16 biți,
semnat pe 32 de biți, nesemnat pe 32 de biți, virgulă mobilă 32 de biți, virgulă mobilă 64
pic

VTI Imagine 3D VTK-XML de intrare și de ieșire (experimental).

Extensii de fișiere recunoscute: .VTI, .vti

Tipuri de elemente acceptate:
semnat 8 biți, nesemnat 8 biți, semnat 16 biți, nesemnat 16 biți, semnat 32
bit, 32 de biți fără semn, virgulă mobilă 32 de biți, virgulă mobilă 64 de biți

vtk Moștenire de intrare și de ieșire a imaginii 3D VTK (experimental).

Extensii de fișiere recunoscute: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage

Tipuri de elemente acceptate:
date binare, semnate pe 8 biți, nesemnate pe 8 biți, semnate pe 16 biți, nesemnate pe 16 biți,
semnat pe 32 de biți, nesemnat pe 32 de biți, virgulă mobilă 32 de biți, virgulă mobilă 64
pic

PLUG-URI: 3dtransform/io

bBS I/uri serializate binare (neportabile) ale transformărilor 3D

Extensii de fișiere recunoscute: .bbs

pool de date IO virtuală către și de la pool-ul de date intern

Extensii de fișiere recunoscute: .@

vista Stocarea Vista a transformărilor 3D

Extensii de fișiere recunoscute: .v, .v3dt

xml IO serializat XML a transformărilor 3D

Extensii de fișiere recunoscute: .x3dt

EXEMPLU

Înregistrați imaginea test.v la imaginea ref.v și scrieți câmpul vector de deformare regfield.v.
Începeți înregistrarea la cea mai mică dimensiune de peste 16 pixeli.

mia-3dfluid -i test.v -r ref.v -o regfield.v -s 16

AUTOR(i)

Gert Wollny

DREPTURI DE AUTOR

Acest software este Copyright (c) 1999‐2015 Leipzig, Germania și Madrid, Spania. Este vorba
FĂRĂ ABSOLUT NU GARANȚIE și o puteți redistribui conform termenilor GNU
LICENȚĂ PUBLICĂ GENERALĂ Versiunea 3 (sau ulterioară). Pentru mai multe informații rulați programul cu
opțiunea „--copyright”.

Utilizați mia-3dfluid online folosind serviciile onworks.net