mia-3dnonrigidreg - Online în cloud

PROGRAM:

NUME

mia-3dnonrigidreg - Înregistrarea neliniară a imaginilor 3D

REZUMAT

mia-3dnonrigidreg -i -r -o [Opțiuni]

DESCRIERE

mia-3dnonrigidreg Acest program implementează înregistrarea a două imagini 3D la scară de gri.

OPŢIUNI

Ajutor & Informație
-V --verbose=avertisment
verbozitatea rezultatelor, mesaje tipărite de nivel dat și priorități mai mari.
Prioritățile acceptate începând de la cel mai de jos nivel sunt:
info ‐ Mesaje de nivel scăzut
urmări ‐ Urmărirea apelului de funcție
eşua ‐ Raportați eșecurile testelor
de avertizare - Avertizări
eroare - Raportează erori
depana - Ieșire de depanare
mesaj ‐ Mesaje normale
fatal ‐ Raportați numai erori fatale

--drepturi de autor
tipăriți informații despre drepturile de autor

-h --ajutor
imprimați acest ajutor

-? --utilizare
imprimați un scurt ajutor

--versiune
tipăriți numărul versiunii și ieșiți

IO
-i --in-image=(input, required); io
imagine de testare Pentru tipurile de fișiere acceptate, consultați PLUGINS:3dimage/io

-r --ref-image=(intrare, necesar); io
imagine de referință Pentru tipurile de fișiere acceptate, consultați PLUGINS:3dimage/io

-o --out-image=(ieșire, necesar); io
imagine de ieșire înregistrată Pentru tipurile de fișiere acceptate, consultați PLUGINS:3dimage/io

-t --transformare=(ieșire); io
transformarea ieșirii Pentru tipurile de fișiere acceptate, consultați PLUGINS:3dtransform/io

Prelucrare
--fire=-1
Numărul maxim de fire de execuție de utilizat pentru procesare, acest număr ar trebui să fie mai mic
sau egal cu numărul de nuclee de procesor logic din mașină. (-1:
estimare automată). Numărul maxim de fire de execuție de utilizat pentru procesare, Aceasta
numărul trebuie să fie mai mic sau egal cu numărul de nuclee de procesor logic în
Mașina. (-1: estimare automată).

Înscriere
-l --levels=3
niveluri cu mai multe rezoluțiiniveluri cu mai multe rezoluții

-O --optimizer=gsl:opt=gd,step=0.1
Optimizer folosit pentru minimizareOptimizer folosit pentru minimizare Pentru
pluginurile acceptate vezi PLUGINS:minimizer/singlecost

-f --transForm=spline:rate=10
tipul de transformare tipul de transformare Pentru pluginurile acceptate vezi
PLUGINE: imagine 3d/transform

PLUG-URI: 1d/nucleu spațial

cdiff Se utilizează nucleul de filtru de diferență centrală, condițiile de limită în oglindă.

(fara parametri)

gauss nucleul filtrului spațial Gauss, parametrii acceptați sunt:

w = 1; uint în [0, inf)
jumătate din lățimea filtrului.

PLUG-URI: 1d/splinebc

oglindă Condiții la limită de interpolare spline care se oglindesc pe graniță

(fara parametri)

repeta Condiții la limită de interpolare spline care repetă valoarea la limită

(fara parametri)

zero Condiții la limită de interpolare spline care presupun zero pentru valorile din afara

(fara parametri)

PLUG-URI: 1d/splinekernel

bspline Crearea nucleului B-spline, parametrii acceptați sunt:

d = 3; int în [0, 5]
Gradul spline.

omoms Crearea nucleului OMoms-spline, parametrii acceptați sunt:

d = 3; int în [3, 3]
Gradul spline.

PLUG-URI: 3dimage/combinator

absdiff Combinator de imagini „absdiff”

(fara parametri)

adăuga Combinatorul de imagini „adăugați”

(fara parametri)

div Combinator de imagini „div”

(fara parametri)

mul Combinator de imagini „mul”

(fara parametri)

sub Combinator de imagini „sub”

(fara parametri)

PLUG-URI: imagine 3d/cost

lncc corelație încrucișată normalizată locală cu suport de mascare., parametrii acceptați
sunt:

w = 5; uint în [1, 256]
jumătate de lățime a ferestrei utilizată pentru evaluarea crucii localizate
corelație.

mi Informații reciproce bazate pe parzen spline., parametrii acceptați sunt:

tăiat = 0; plutește în [0, 40]
Procentul de pixeli de tăiat la intensități mari și scăzute de eliminat
valori aberante.

mbins = 64; uint în [1, 256]
Numărul de casete de histograme utilizate pentru imaginea în mișcare.

mkernel = [bspline:d=3]; fabrică
Nucleu spline pentru imaginea în mișcare parzen hinstogram. Pentru plug-in-uri acceptate
vezi PLUGINS:1d/splinekernel

rbins = 64; uint în [1, 256]
Numărul de casete de histograme utilizate pentru imaginea de referință.

rkernel = [bspline:d=0]; fabrică
Nucleu spline pentru imaginea de referință parzen hinstogram. Pentru conectorul acceptat-
ins vezi PLUGINS:1d/splinekernel

CCN corelație încrucișată normalizată.

(fara parametri)

ngf Această funcție evaluează asemănarea imaginii pe baza gradientului normalizat
câmpuri. Având în vedere câmpurile de gradient normalizate $ _S$ ale imaginii src și $ _R$ ale
ref image sunt implementați diverși evaluatori., parametrii acceptați sunt:

eval = ds; dict
subtipul pluginului (sq, ds, dot, cross). Valorile acceptate sunt:
ds ‐ pătratul diferenței de scară
punct ‐ nucleul de produs scalar
trece ‐ nucleu de produs încrucișat

SSD Costul imaginii 3D: suma diferențelor pătrate, parametrii acceptați sunt:

autothresh = 0; plutește în [0, 1000]
Utilizați mascarea automată a imaginii în mișcare luând doar valori de intensitate
în considerare care sunt mai mari decât pragul dat.

normă = 0; bool
Setați dacă valoarea ar trebui să fie normalizată în funcție de numărul de pixeli ai imaginii.

ssd-automask
Costul imaginii 3D: suma diferențelor pătrate, cu automascare bazată pe date
pragurile, parametrii acceptați sunt:

rthresh = 0; dubla
Valoarea intensității pragului pentru imaginea de referință.

sthresh = 0; dubla
Valoarea intensității pragului pentru imaginea sursă.

PLUG-URI: imagine 3d/filtru

bandpass filtru trece-bandă de intensitate, parametrii acceptați sunt:

max = 3.40282e+38; pluti
maxim al benzii.

minute = 0; pluti
minim al benzii.

binariza filtrul de binarizare a imaginii, parametrii acceptați sunt:

max = 3.40282e+38; pluti
maximul intervalului acceptat.

minute = 0; pluti
minim de interval acceptat.

închide Parametrii de apropiere morfologici suportati sunt:

aluzie = negru; şir
un indiciu asupra conținutului imaginii principale (negru|alb).

forma = [sfera:r=2]; fabrică
element de structurare. Pentru pluginuri acceptate, consultați PLUGINS:3dimage/shape

combiner Combinați două imagini cu operatorul combinator dat. dacă „reverse” este setat la
false, primul operator este imaginea trecută prin conducta filtrului și
a doua imagine este încărcată din fișierul dat cu parametrul 'image' the
în momentul în care filtrul este rulat, parametrii acceptați sunt:

imagine =(intrare, obligatoriu, șir)
a doua imagine care este necesară în combinator.

op =(obligatoriu, din fabrică)
Combinatorul de imagini care urmează să fie aplicat imaginilor. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: imagine 3d/combinator

inversa = 0; bool
inversează ordinea în care imaginile au trecut la combinator.

converti filtrul de conversie a formatului de pixeli ai imaginii, parametrii acceptați sunt:

a = 1; pluti
parametrul de conversie liniară a.

b = 0; pluti
parametrul de conversie liniară b.

Hartă = opta; dict
cartografierea conversiei. Valorile acceptate sunt:
opta ‐ aplicați o transformare liniară care mapează domeniul de intrare real la
întregul interval de ieșire
gamă ‐ aplicați transformarea liniară care mapează tipul de date de intrare
interval la intervalul de tip de date de ieșire
copiaţi ‐ copiați datele la conversie
liniar ‐ se aplică transformarea liniară x -> a*x+b
optstat ‐ aplicați o transformare liniară care se mapează pe baza mediei de intrare și
variație la întreaga gamă de ieșire

repn = ubyte; dict
tip de pixel de ieșire. Valorile acceptate sunt:
nici unul ‐ nu este definit niciun tip de pixel
pluti ‐ virgulă mobilă 32 de biți
sbyte ‐ semnat pe 8 biți
ulong ‐ nesemnat pe 64 de biți
dubla ‐ virgulă mobilă 64 de biți
Sint ‐ semnat pe 32 biți
scurt ‐ nesemnat pe 16 de biți
sscurt ‐ semnat pe 16 biți
int ‐ nesemnat pe 32 de biți
slong ‐ semnat pe 64 biți
pic ‐ date binare
ubyte ‐ nesemnat pe 8 de biți

cultură Decupați o regiune a unei imagini, regiunea este întotdeauna fixată la imaginea originală
dimensiunea în sensul că se păstrează intervalul dat., parametrii acceptați sunt:

capăt = [[4294967295,4294967295,4294967295]]; transmisibil în flux
sfârșitul intervalului de decupare, maxim = (-1,-1,-1).

Începe = [[0,0,0]]; transmisibil în flux
începutul intervalului de decupare.

delată Filtrul de dilatare a stivei de imagini 3D, parametrii acceptați sunt:

aluzie = negru; şir
un indiciu asupra conținutului imaginii principale (negru|alb).

forma = [sfera:r=2]; fabrică
element de structurare. Pentru pluginuri acceptate, consultați PLUGINS:3dimage/shape

distanţă Evaluați transformarea la distanță 3D a unei imagini. Dacă imaginea este o mască binară,
atunci rezultatul transformării distanței în fiecare punct corespunde euclidianului
distanta pana la masca. Dacă imaginea de intrare are o valoare scalară a pixelului, atunci
acest scalar este interpretat ca câmp înălțime și valoarea per pixel se adaugă la
distanţă.

(fara parametri)

downscale Reducerea imaginii de intrare utilizând o dimensiune de bloc dată pentru a defini reducerea reducerii
factor. Înainte de scalare, imaginea este filtrată printr-un filtru de netezire la
eliminați datele de înaltă frecvență și evitați artefactele de aliasing., acceptat
parametrii sunt:

b = [[1,1,1]]; 3dbounds
dimensiunea blocului.

bx = 1; uint în [1, inf)
dimensiunea blocului în direcția x.

by = 1; uint în [1, inf)
dimensiunea blocului în direcția y.

bz = 1; uint în [1, inf)
dimensiunea blocului în direcția z.

nucleu = gauss; şir
nucleul filtrului de netezire care urmează să fie aplicat, dimensiunea filtrului este estimată
pe baza dimensiunii blocului..

eroda Filtrul de erodare a stivei de imagini 3D, parametrii acceptați sunt:

aluzie = negru; şir
un indiciu asupra conținutului imaginii principale (negru|alb).

forma = [sfera:r=2]; fabrică
element de structurare. Pentru pluginuri acceptate, consultați PLUGINS:3dimage/shape

gauss filtru gauss 3D izotrop, parametrii acceptați sunt:

w = 1; int în [0, inf)
parametrul lățimii filtrului.

gradnorm Imagine 3D la filtru normal de gradient

(fara parametri)

masca de crestere Utilizați o mască binară de intrare și o imagine de referință în scară de gri pentru a face creșterea regiunii
prin adăugarea pixelilor de vecinătate ai unui pixel deja adăugat dacă au un pixel mai mic
intensitatea care este peste pragul dat., parametrii acceptați sunt:

minute = 1; pluti
pragul inferior pentru creșterea măștilor.

ref =(intrare, obligatoriu, șir)
imagine de referință pentru creșterea regiunii măști.

forma = 6n; fabrică
masca de cartier. Pentru pluginuri acceptate, consultați PLUGINS:3dimage/shape

inversa filtru invers de intensitate

(fara parametri)

izovoxel Acest filtru scalează o imagine pentru a face ca dimensiunea voxelului să fie izometrică și dimensiunea acesteia la
corespund valorii date, parametrii acceptați sunt:

interp = [bspline:d=3]; fabrică
nucleul de interpolare care trebuie utilizat. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/splinekernel

mărimea = 1; plutește în (0, inf)
dimensiunea voxelului țintă izometrică.

kmans Filtru K-Means de imagine 3D. În imaginea de ieșire, valoarea pixelului reprezintă
apartenența la clasă și centrele de clasă sunt stocate ca atribut în imagine.,
parametrii acceptați sunt:

c = 3; int în [2, inf)
numărul de clase.

etichetă Un filtru pentru a eticheta componentele conectate ale unei imagini binare., acceptat
parametrii sunt:

n = 6n; fabrică
masca de cartier. Pentru pluginuri acceptate, consultați PLUGINS:3dimage/shape

labelmap Filtru de imagine pentru a remapa ID-urile etichetelor. Se aplică numai imaginilor cu valori întregi
intensități/etichete., parametrii acceptați sunt:

Hartă =(intrare, obligatoriu, șir)
Etichetați fișierul de mapare.

scara de etichete
Un filtru care creează numai voxeli de ieșire care sunt deja creați în intrare
imagine. Scalare se face prin utilizarea unui algoritm de vot care selectează ținta
valoarea pixelilor bazată pe cel mai mare număr de pixeli dintr-o anumită etichetă din
regiunea sursă corespunzătoare. Dacă regiunea cuprinde două etichete cu aceeași
count, cel cu numărul mai mic câștigă., parametrii acceptați sunt:

exagerat =(obligatoriu, 3dbounds)
dimensiunea țintă dată ca două valori separate de coma.

încărca Încărcați imaginea de intrare dintr-un fișier și utilizați-o pentru a înlocui imaginea curentă în fișierul
pipeline., parametrii acceptați sunt:

fişier =(intrare, obligatoriu, șir)
numele fișierului de intrare de încărcat din...

lvdownscale
Acesta este un filtru de reducere a votului de etichetă. Reduce o imagine 3D prin blocuri.
Pentru fiecare bloc eticheta (diferită de zero) care apare de cele mai multe ori în bloc este
emis ca pixel de ieșire în imaginea țintă. Dacă două etichete apar același număr
de ori, cel cu valoarea absolută mai mică câștigă., parametrii acceptați sunt:

b = [[1,1,1]]; 3dbounds
blocksize pentru reducere. Fiecare bloc va fi reprezentat de un pixel
in imaginea tinta..

masca Mascați o imagine, o imagine este luată din lista de parametri și cealaltă din
intrarea normală a filtrului. Ambele imagini trebuie să aibă aceleași dimensiuni și una trebuie
fi binar. Atributele imaginii care vine prin conducta filtrului sunt
conservate. Tipul de pixel de ieșire corespunde imaginii de intrare care nu este
binary., parametrii acceptați sunt:

intrare =(intrare, obligatoriu, șir)
al doilea nume de fișier imagine de intrare.

însemna Filtrul mediu al imaginii 3D, parametrii acceptați sunt:

w = 1; int în [1, inf)
jumătate din lățimea filtrului.

mediană filtru median 3d, parametrii acceptați sunt:

w = 1; int în [1, inf)
parametrul lățimii filtrului.

MLV Filtrul de imagine 3D pentru media variației minime, parametrii acceptați sunt:

w = 1; int în [1, inf)
parametrul lățimii filtrului.

msnormalizer
Filtru de normalizare medie-sigma a imaginii 3D, parametrii acceptați sunt:

w = 1; int în [1, inf)
jumătate din lățimea filtrului.

deschide parametrii morfologici deschisi, suportati sunt:

aluzie = negru; şir
un indiciu asupra conținutului imaginii principale (negru|alb).

forma = [sfera:r=2]; fabrică
element de structurare. Pentru pluginuri acceptate, consultați PLUGINS:3dimage/shape

reorientează Filtrul de reorientare a imaginii 3D, parametrii acceptați sunt:

Hartă = xyz; dict
cartografierea de orientare care urmează să fie aplicată. Valorile acceptate sunt:
p-zxy ‐ permută x->y->z->x
r-x180 ‐ rotiți în jurul axei x în sensul acelor de ceasornic la 180 de grade
xyz ‐ păstrează orientarea
p-yzx ‐ permută x->z->y->x
r-z180 ‐ rotiți în jurul axei z în sensul acelor de ceasornic la 180 de grade
r-y270 ‐ rotiți în jurul axei y în sensul acelor de ceasornic la 270 de grade
f-xz ‐ flip xz
f-yz ‐ flip yz
r-x90 ‐ rotiți în jurul axei x în sensul acelor de ceasornic la 90 de grade
r-y90 ‐ rotiți în jurul axei y în sensul acelor de ceasornic la 90 de grade
r-x270 ‐ rotiți în jurul axei x în sensul acelor de ceasornic la 270 de grade
r-z270 ‐ rotiți în jurul axei z în sensul acelor de ceasornic la 270 de grade
r-z90 ‐ rotiți în jurul axei z în sensul acelor de ceasornic la 90 de grade
f-xy ‐ flip xy
r-y180 ‐ rotiți în jurul axei y în sensul acelor de ceasornic la 180 de grade

redimensiona Redimensionați o imagine. Datele originale sunt centrate în noua imagine de dimensiune.,
parametrii acceptați sunt:

mărimea = [[0,0,0]]; transmisibil în flux
dimensiune nouă a imaginii o dimensiune 0 indică pentru a păstra dimensiunea pentru
dimensiunea corespunzatoare..

sandp Filtru 3d de sare și piper, parametrii acceptați sunt:

treieră = 100; plutește în [0, inf)
valoarea pragului.

w = 1; int în [1, inf)
parametrul lățimii filtrului.

scară Filtru de imagine 3D care se scalează la o dimensiune țintă dată, parametrii acceptați sunt:

interp = [bspline:d=3]; fabrică
nucleul de interpolare care trebuie utilizat. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/splinekernel

s = [[0,0,0]]; 3dbounds
dimensiunea țintă pentru a seta toate componentele simultan (componenta 0: utilizați imaginea de intrare
mărimea).

sx = 0; uint în [0, inf)
dimensiunea țintă în direcția x (0: utilizați dimensiunea imaginii de intrare).

sy = 0; uint în [0, inf)
dimensiunea țintă în direcția y (0: utilizați dimensiunea imaginii de intrare).

sz = 0; uint în [0, inf)
dimensiunea țintă în direcția y (0: utilizați dimensiunea imaginii de intrare).

selectbig Un filtru care creează o mască binară reprezentând intensitatea cu cea mai mare
pixel count.Valoarea pixelului 0 va fi ignorată, iar dacă două intensități au
același număr de pixeli, atunci rezultatul este nedefinit. Pixelul de intrare trebuie să aibă un
tip de pixel integral.

(fara parametri)

sepconv Filtru de convoluție separat pentru intensitatea imaginii 3D, parametrii acceptați sunt:

kx = [gauss:w=1]; fabrică
nucleul de filtrare în direcția x. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/spacialkernel

ky = [gauss:w=1]; fabrică
nucleul de filtrare în direcția y. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/spacialkernel

kz = [gauss:w=1]; fabrică
nucleul de filtrare în direcția z. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/spacialkernel

saw cap de apă însămânțat. Algoritmul extrage exact atât de multe regiuni ca inițial
etichetele sunt date în imaginea semințelor., parametrii acceptați sunt:

grad = 0; bool
Interpretați imaginea de intrare ca gradient. .

marca = 0; bool
Marcați bazinele hidrografice segmentate cu o valoare specială de scară de gri.

n = [sfera:r=1]; fabrică
Cartier pentru regiunea Watershead în creștere. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: imagine/formă 3d

sămânţă =(intrare, obligatoriu, șir)
imagine de intrare semințe care conține etichetele pentru regiunile inițiale.

reper Salvați imaginea de intrare într-un fișier și, de asemenea, treceți-o la următorul filtru,
parametrii acceptați sunt:

fişier =(ieșire, necesar, șir)
numele fișierului de ieșire pentru a salva și imaginea..

subțierea Subțierea morfologică 3D, bazată pe: Lee și Kashyap, „Building Skeleton Models”
prin intermediul algoritmilor de subțiere a suprafeței mediale/axelor 3-D, modele grafice și imagine
Prelucrarea, 56(6):462-478, 1994. Această implementare acceptă doar 26
Cartier.

(fara parametri)

transforma Transformați imaginea de intrare cu transformarea dată., parametrii acceptați
sunt:

fişier =(intrare, obligatoriu, șir)
Numele fișierului care conține transformarea..

imgboundary = ; şir
suprascrie condițiile de limită de interpolare a imaginii.

imgkernel = ; şir
suprascrie nucleul interpolatorului de imagini.

dezacord Filtrul de variație a imaginii 3D, parametrii acceptați sunt:

w = 1; int în [1, inf)
jumătate din lățimea filtrului.

ws Segmentarea de bază a capului de apă, parametrii acceptați sunt:

evalgrad = 0; bool
Setați la 1 dacă imaginea de intrare nu reprezintă o imagine normală cu gradient.

marca = 0; bool
Marcați bazinele hidrografice segmentate cu o valoare specială de scară de gri.

n = [sfera:r=1]; fabrică
Cartier pentru regiunea Watershead în creștere. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: imagine/formă 3d

treieră = 0; plutește în [0, 1)
Pragul de normă de gradient relativ. Valoarea pragului valorii reale este
thresh * (max_grad - min_grad) + min_grad. Bazine separate prin gradienți
cu o normă inferioară se vor alătura.

PLUG-URI: Imagine 3d/cost complet

imagine Funcția generalizată a costului de similitudine a imaginii care gestionează și rezoluția multiplă
prelucrare. Măsura reală a asemănării este dat un parametru suplimentar.,
parametrii acceptați sunt:

costa = ssd; fabrică
Nucleul funcției de cost. Pentru pluginuri acceptate, consultați PLUGINS:3dimage/cost

depana = 0; bool
Salvați rezultatele intermediare pentru depanare.

ref =(intrare, șir)
Imagine de referință.

src =(intrare, șir)
Imagine de studiu.

greutate = 1; pluti
ponderea funcției de cost.

labelimage
Funcția de cost de similaritate care mapează etichetele a două imagini și gestionează etichetele-
păstrând procesarea multi-rezoluție., parametrii acceptați sunt:

maxlabel = 256; int în [2, 32000]
numărul maxim de etichete de luat în considerare.

ref =(intrare, șir)
Imagine de referință.

src =(intrare, șir)
Imagine de studiu.

greutate = 1; pluti
ponderea funcției de cost.

imagine mascata
Funcția generalizată a costului de similitudine a imaginilor mascate care gestionează, de asemenea, mai multe
procesarea rezoluției. Măștile furnizate ar trebui să fie umplute cu densitate în regiuni
procesare cu rezoluție multiplă, deoarece altfel informațiile despre mască se pot pierde
la reducerea scalarii imaginii. Masca poate fi prefiltrată - după prefiltrare
măștile trebuie să fie de tip biți.Masca de referință și masca transformată a
imaginile de studiu sunt combinate prin AND binar. Este dată măsura reală a asemănării
este un parametru suplimentar, parametrii acceptați sunt:

costa = ssd; fabrică
Nucleul funcției de cost. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: imagine 3d/cost mascat

ref =(intrare, șir)
Imagine de referință.

ref-mască =(intrare, șir)
Mască imagine de referință (binară).

ref-mască-filtru = ; fabrică
Filtrați pentru a pregăti imaginea măștii de referință, rezultatul trebuie să fie binar
imagine.. Pentru pluginuri acceptate, consultați PLUGINS:3dimage/filter

src =(intrare, șir)
Imagine de studiu.

src-mask =(intrare, șir)
Mască de studiu de imagine (binară).

src-mask-filter = ; fabrică
Filtru pentru a pregăti imaginea măștii de studiu, rezultatul trebuie să fie binar
imagine.. Pentru pluginuri acceptate, consultați PLUGINS:3dimage/filter

greutate = 1; pluti
ponderea funcției de cost.

etichetatssd Evaluează măsura de similitudine a Sumei diferențelor pătrate folosind trei
perechi de imagini etichetate. Valoarea funcției de cost este evaluată pe baza tuturor imaginilor
perechi, dar gradientul este compus prin alcătuirea componentei sale pe baza etichetei
direcție., parametrii acceptați sunt:

refx =(intrare, șir)
Imagine de referință X-tag.

refy =(intrare, șir)
Imagine de referință Y-tag.

refz =(intrare, șir)
Imagine de referință Z-tag.

srcx =(intrare, șir)
Studiați imaginea X-tag.

srcy =(intrare, șir)
Studiați imaginea Y-tag.

srcz =(intrare, șir)
Studiați imaginea Z-tag.

greutate = 1; pluti
ponderea funcției de cost.

PLUG-URI: 3dimage/io

analiza Analizați imaginea 7.5

Extensii de fișiere recunoscute: .HDR, .hdr

Tipuri de elemente acceptate:
8 biți nesemnat, 16 biți semnat, 32 de biți semnat, 32 de biți în virgulă mobilă,
virgulă mobilă 64 de biți

pool de date IO virtuală către și de la pool-ul de date intern

Extensii de fișiere recunoscute: .@

dicom Seria de imagini Dicom ca 3D

Extensii de fișiere recunoscute: .DCM, .dcm

Tipuri de elemente acceptate:
semnat pe 16 biți, nesemnat pe 16 biți

hdf5 HDF5 3D imagine IO

Extensii de fișiere recunoscute: .H5, .h5

Tipuri de elemente acceptate:
date binare, semnate pe 8 biți, nesemnate pe 8 biți, semnate pe 16 biți, nesemnate pe 16 biți,
semnat pe 32 de biți, nesemnat pe 32 de biți, semnat pe 64 de biți, nesemnat pe 64 de biți, flotant
punct 32 de biți, virgulă mobilă 64 de biți

inria Imaginea INRIA

Extensii de fișiere recunoscute: .INR, .inr

Tipuri de elemente acceptate:
semnat 8 biți, nesemnat 8 biți, semnat 16 biți, nesemnat 16 biți, semnat 32
bit, 32 de biți fără semn, virgulă mobilă 32 de biți, virgulă mobilă 64 de biți

mhd MetaIO 3D imagine IO folosind implementarea VTK (experimental).

Extensii de fișiere recunoscute: .MHA, .MHD, .mha, .mhd

Tipuri de elemente acceptate:
semnat 8 biți, nesemnat 8 biți, semnat 16 biți, nesemnat 16 biți, semnat 32
bit, 32 de biți fără semn, virgulă mobilă 32 de biți, virgulă mobilă 64 de biți

nifti Imagine 1D NIFTI-3 IO

Extensii de fișiere recunoscute: .NII, .nii

Tipuri de elemente acceptate:
semnat 8 biți, nesemnat 8 biți, semnat 16 biți, nesemnat 16 biți, semnat 32
bit, nesemnat pe 32 de biți, semnat pe 64 de biți, fără semn pe 64 de biți, virgulă mobilă 32
bit, virgulă mobilă 64 de biți

vff Format raster VFF Sun

Extensii de fișiere recunoscute: .VFF, .vff

Tipuri de elemente acceptate:
nesemnat pe 8 biți, semnat pe 16 biți

vista Vizualizare 3D

Extensii de fișiere recunoscute: .V, .VISTA, .v, .vista

Tipuri de elemente acceptate:
date binare, semnate pe 8 biți, nesemnate pe 8 biți, semnate pe 16 biți, nesemnate pe 16 biți,
semnat pe 32 de biți, nesemnat pe 32 de biți, virgulă mobilă 32 de biți, virgulă mobilă 64
pic

VTI Imagine 3D VTK-XML de intrare și de ieșire (experimental).

Extensii de fișiere recunoscute: .VTI, .vti

Tipuri de elemente acceptate:
semnat 8 biți, nesemnat 8 biți, semnat 16 biți, nesemnat 16 biți, semnat 32
bit, 32 de biți fără semn, virgulă mobilă 32 de biți, virgulă mobilă 64 de biți

vtk Moștenire de intrare și de ieșire a imaginii 3D VTK (experimental).

Extensii de fișiere recunoscute: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage

Tipuri de elemente acceptate:
date binare, semnate pe 8 biți, nesemnate pe 8 biți, semnate pe 16 biți, nesemnate pe 16 biți,
semnat pe 32 de biți, nesemnat pe 32 de biți, virgulă mobilă 32 de biți, virgulă mobilă 64
pic

PLUG-URI: 3dimage/maskedcost

lncc corelație încrucișată normalizată locală cu suport de mascare., parametrii acceptați
sunt:

w = 5; uint în [1, 256]
jumătate de lățime a ferestrei utilizată pentru evaluarea crucii localizate
corelație.

mi Informații reciproce bazate pe parzen spline cu mascare, parametrii acceptați sunt:

tăiat = 0; plutește în [0, 40]
Procentul de pixeli de tăiat la intensități mari și scăzute de eliminat
valori aberante.

mbins = 64; uint în [1, 256]
Numărul de casete de histograme utilizate pentru imaginea în mișcare.

mkernel = [bspline:d=3]; fabrică
Nucleu spline pentru imaginea în mișcare parzen hinstogram. Pentru plug-in-uri acceptate
vezi PLUGINS:1d/splinekernel

rbins = 64; uint în [1, 256]
Numărul de casete de histograme utilizate pentru imaginea de referință.

rkernel = [bspline:d=0]; fabrică
Nucleu spline pentru imaginea de referință parzen hinstogram. Pentru conectorul acceptat-
ins vezi PLUGINS:1d/splinekernel

CCN corelație încrucișată normalizată cu suport de mascare.

(fara parametri)

SSD Suma pătratelor diferențelor cu mascarea.

(fara parametri)

PLUG-URI: Imagine 3d/formă

18n Creator de forme 18D de cartier 3n

(fara parametri)

26n Creator de forme 26D de cartier 3n

(fara parametri)

6n Creator de forme 6D de cartier 3n

(fara parametri)

sferă Vecinătate de formă sferică închisă, inclusiv pixelii dintr-o rază dată
r., parametrii acceptați sunt:

r = 2; plutește în (0, inf)
raza sferei.

PLUG-URI: Imagine 3d/transformare

afine Transformare afină (12 grade de libertate), parametrii acceptați sunt:

imgboundary = oglinda; fabrică
condiţiile limită de interpolare a imaginii. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/splinebc

imgkernel = [bspline:d=3]; fabrică
nucleu interpolator de imagini. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/splinekernel

axisrot Transformare de rotație restricționată (1 grad de libertate). Transformarea este
limitată la rotația în jurul axei date în jurul rotației date
centru, parametrii acceptați sunt:

axă =(obligatoriu, 3dfvector)
axa de rotatie.

imgboundary = oglinda; fabrică
condiţiile limită de interpolare a imaginii. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/splinebc

imgkernel = [bspline:d=3]; fabrică
nucleu interpolator de imagini. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/splinekernel

origine =(obligatoriu, 3dfvector)
centrul transformării.

rafinat Transformare afină restrânsă (3 grade de libertate). Transformarea este
limitată la rotația în jurul axei date și la forfecare de-a lungul celor două axe
perpendicular pe cel dat, parametrii suportați sunt:

axă =(obligatoriu, 3dfvector)
axa de rotatie.

imgboundary = oglinda; fabrică
condiţiile limită de interpolare a imaginii. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/splinebc

imgkernel = [bspline:d=3]; fabrică
nucleu interpolator de imagini. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/splinekernel

origine =(obligatoriu, 3dfvector)
centrul transformării.

rigid Transformare rigidă, adică rotație și translație (șase grade de libertate).,
parametrii acceptați sunt:

imgboundary = oglinda; fabrică
condiţiile limită de interpolare a imaginii. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/splinebc

imgkernel = [bspline:d=3]; fabrică
nucleu interpolator de imagini. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/splinekernel

origine = [[0,0,0]]; 3dfvector
Centrul de rotație relativ, adică <0.5,0.5,0.5> corespunde centrului de
volumul.

rotaţie Transformarea rotației (trei grade de libertate), parametrii acceptați sunt:

imgboundary = oglinda; fabrică
condiţiile limită de interpolare a imaginii. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/splinebc

imgkernel = [bspline:d=3]; fabrică
nucleu interpolator de imagini. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/splinekernel

origine = [[0,0,0]]; 3dfvector
Centrul de rotație relativ, adică <0.5,0.5,0.5> corespunde centrului de
volumul.

putrezit Transformare restrânsă (4 grade de libertate). Transformarea este
limitată la rotația în jurul axei x și y și la o îndoire de-a lungul axei x
axă, independentă în fiecare direcție, cu îndoirea crescând odată cu
distanța pătrată față de axa de rotație, parametrii acceptați sunt:

imgboundary = oglinda; fabrică
condiţiile limită de interpolare a imaginii. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/splinebc

imgkernel = [bspline:d=3]; fabrică
nucleu interpolator de imagini. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/splinekernel

norot = 0; bool
Nu optimizați rotația.

origine =(obligatoriu, 3dfvector)
centrul transformării.

spline Transformare în formă liberă care poate fi descrisă printr-un set de coeficienți B-spline
și un nucleu B-spline subiacent., parametrii acceptați sunt:

anizorat = [[0,0,0]]; 3dfvector
rata coeficientului anizotrop în pixeli, valorile nepozitive vor fi
suprascris cu valoarea „rata”...

depana = 0; bool
activați ieșirea suplimentară de depanare.

imgboundary = oglinda; fabrică
condiţiile limită de interpolare a imaginii. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/splinebc

imgkernel = [bspline:d=3]; fabrică
nucleu interpolator de imagini. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/splinekernel

nucleu = [bspline:d=3]; fabrică
nucleu spline de transformare. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/splinekernel

penalizare = ; fabrică
termen energetic penalizare transformare. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 3dtransform/splinepenalty

rată = 10; plutește în [1, inf)
rata coeficientului izotrop în pixeli.

Traduceți Translația (trei grade de libertate), parametrii acceptați sunt:

imgboundary = oglinda; fabrică
condiţiile limită de interpolare a imaginii. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/splinebc

imgkernel = [bspline:d=3]; fabrică
nucleu interpolator de imagini. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/splinekernel

vf Acest plug-in implementează o transformare care definește o traducere pentru fiecare
punct al grilei care definește domeniul transformării., susținut
parametrii sunt:

imgboundary = oglinda; fabrică
condiţiile limită de interpolare a imaginii. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/splinebc

imgkernel = [bspline:d=3]; fabrică
nucleu interpolator de imagini. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/splinekernel

PLUG-URI: 3dtransform/io

bBS I/uri serializate binare (neportabile) ale transformărilor 3D

Extensii de fișiere recunoscute: .bbs

pool de date IO virtuală către și de la pool-ul de date intern

Extensii de fișiere recunoscute: .@

vista Stocarea Vista a transformărilor 3D

Extensii de fișiere recunoscute: .v, .v3dt

xml IO serializat XML a transformărilor 3D

Extensii de fișiere recunoscute: .x3dt

PLUG-URI: 3dtransform/splinepenalty

divcurl penalizare divcurl la transformare, parametrii acceptați sunt:

răsuci = 1; plutește în [0, inf)
greutate penalizare pe buclă.

div = 1; plutește în [0, inf)
ponderea penalizării pe divergență.

normă = 0; bool
Setați la 1 dacă penalizarea ar trebui să fie normalizată în raport cu imaginea
mărimea.

greutate = 1; plutește în (0, inf)
greutatea energiei de penalizare.

PLUG-URI: minimizator/cost unic

gdas Coborâre în gradient cu corectare automată a mărimii pasului, parametrii acceptați sunt:

ftolr = 0; dubla în [0, inf)
Opriți dacă modificarea relativă a criteriului este mai jos..

max-pas = 2; dubla in (0, inf)
Dimensiunea maximă absolută a pasului.

maxiter = 200; uint în [1, inf)
Criteriul de oprire: numărul maxim de iterații.

pas min = 0.1; dubla in (0, inf)
Dimensiune minimă absolută a pasului.

xtola = 0.01; dubla în [0, inf)
Opriți dacă norma inf a modificării aplicate lui x este sub această valoare..

gdsq Coborâre în gradient cu estimarea pasului pătratic, parametrii acceptați sunt:

ftolr = 0; dubla în [0, inf)
Opriți dacă modificarea relativă a criteriului este mai jos..

gtola = 0; dubla în [0, inf)
Opriți dacă norma inf a gradientului este sub această valoare.

maxiter = 100; uint în [1, inf)
Criteriul de oprire: numărul maxim de iterații.

scară = 2; dubla in (1, inf)
Scalarea dimensiunii pasului de rezervă fixă.

pas = 0.1; dubla in (0, inf)
Mărimea pasului inițial.

xtola = 0; dubla în [0, inf)
Opriți dacă norma inf a x-update este sub această valoare.

GSL Plugin de optimizare bazat pe optimizatoarele multimin ale Bibliotecii științifice GNU
(GSL) https://www.gnu.org/software/gsl/, parametrii acceptați sunt:

eps = 0.01; dubla in (0, inf)
Optimizatoare bazate pe gradient: opriți când |grad| < eps, simplex: opriți când
dimensiune simplex < eps..

proces = 100; uint în [1, inf)
numărul maxim de iterații.

opta = gd; dict
Optimizator specific care trebuie utilizat.. Valorile acceptate sunt:
bfgs ‐ Broyden-Fletcher-Goldfarb-Shann
bfgs2 ‐ Broyden-Fletcher-Goldfarb-Shann (cea mai eficientă versiune)
cg-fr ‐ Algoritmul de gradient conjugat Flecher-Reeves
gd ‐ Coborâre în gradient.
simplex ‐ Algoritmul Simplex al lui Nelder și Mead
cg-pr ‐ Algoritmul de gradient conjugat Polak-Ribiere

pas = 0.001; dubla in (0, inf)
dimensiunea inițială a pasului.

tol = 0.1; dubla in (0, inf)
un parametru de toleranță.

nlopt Algoritmi de minimizare folosind biblioteca NLOPT, pentru o descriere a
optimizatori vă rugăm să vedeți „http://ab-
initio.mit.edu/wiki/index.php/NLopt_Algorithms', parametrii acceptați sunt:

ftola = 0; dubla în [0, inf)
Criteriul de oprire: modificarea absolută a valorii obiective este mai jos
această valoare.

ftolr = 0; dubla în [0, inf)
Criteriul de oprire: modificarea relativă a valorii obiective este mai jos
această valoare.

superior = inf; dubla
Limită superioară (egale pentru toți parametrii).

local-opt = niciunul; dict
algoritm local de minimizare care poate fi necesar pentru principal
algoritm de minimizare.. Valorile acceptate sunt:
gn-orig-direct-l ‐ Împărțirea dreptunghiurilor (implementare originală,
părtinitoare local)
gn-direct-l-noscal ‐ Împărțirea dreptunghiurilor (nescalate, părtinitoare local)
gn-isres ‐ Strategie îmbunătățită de evoluție a clasamentului stocastic
ld-tnewton ‐ Newton trunchiat
gn-direct-l-rand ‐ Împărțirea dreptunghiurilor (părtinitoare local, randomizat)
ln-newuoa ‐ Optimizare neconstrânsă fără derivate prin iterativ
Aproximație cuadratică construită
gn-direct-l-rand-noscale ‐ Împărțirea dreptunghiurilor (nescalate, local
părtinitoare, randomizată)
gn-orig-direct ‐ Împărțirea dreptunghiurilor (implementare originală)
ld-tnewton-precond ‐ Newton trunchiat precondiționat
ld-tnewton-repornire ‐ Newton trunchiat cu repornirea cu cea mai abruptă coborâre
gn-direct ‐ Împărțirea dreptunghiurilor
ln-neldermead ‐ Algoritmul simplex Nelder-Mead
ln-cobyla ‐ Optimizare constrânsă PRIN Aproximare Lineară
gn-crs2-lm ‐ Căutare aleatoare controlată cu mutație locală
ld-var2 ‐ Variabilă-Metrică cu memorie limitată deplasată, rangul 2
ld-var1 ‐ Variabilă-Metrică cu memorie limitată deplasată, rangul 1
ld-mma ‐ Metoda de mutare a asimptotelor
ld-lbfgs-nocedal - Nici unul
ld-lbfgs ‐ BFGS cu stocare redusă
gn-direct-l ‐ Împărțirea dreptunghiurilor (părtinitoare local)
nici unul ‐ nu specificați algoritmul
ln-bobyqa ‐ Optimizare limitată de legaturi fără derivate
ln-sbplx ‐ Varianta subplex a lui Nelder-Mead
ln-newuoa-legat ‐ Optimizare fără derivate limitate de legături de
Aproximație cuadratică construită iterativ
ln-praxis ‐ Optimizare locală fără gradient prin axa principală
Metodă
gn-direct-noscal ‐ Împărțirea dreptunghiurilor (nescalate)
ld-tnewton-precond-restart ‐ Newton trunchiat precondiționat cu
repornirea la cea mai abruptă coborâre

LOWER = -inf; dubla
Limită inferioară (egal pentru toți parametrii).

maxiter = 100; int în [1, inf)
Criteriul de oprire: numărul maxim de iterații.

opta = ld-lbfgs; dict
algoritmul principal de minimizare. Valorile acceptate sunt:
gn-orig-direct-l ‐ Împărțirea dreptunghiurilor (implementare originală,
părtinitoare local)
g-mlsl-lds ‐ Conectare unică pe mai multe niveluri (secvență cu discrepanță scăzută,
necesită optimizare și limite bazate pe gradient local)
gn-direct-l-noscal ‐ Împărțirea dreptunghiurilor (nescalate, părtinitoare local)
gn-isres ‐ Strategie îmbunătățită de evoluție a clasamentului stocastic
ld-tnewton ‐ Newton trunchiat
gn-direct-l-rand ‐ Împărțirea dreptunghiurilor (părtinitoare local, randomizat)
ln-newuoa ‐ Optimizare neconstrânsă fără derivate prin iterativ
Aproximație cuadratică construită
gn-direct-l-rand-noscale ‐ Împărțirea dreptunghiurilor (nescalate, local
părtinitoare, randomizată)
gn-orig-direct ‐ Împărțirea dreptunghiurilor (implementare originală)
ld-tnewton-precond ‐ Newton trunchiat precondiționat
ld-tnewton-repornire ‐ Newton trunchiat cu repornirea cu cea mai abruptă coborâre
gn-direct ‐ Împărțirea dreptunghiurilor
auglag-eq ‐ Algoritm lagrangian crescut cu constrângeri de egalitate
afară
ln-neldermead ‐ Algoritmul simplex Nelder-Mead
ln-cobyla ‐ Optimizare constrânsă PRIN Aproximare Lineară
gn-crs2-lm ‐ Căutare aleatoare controlată cu mutație locală
ld-var2 ‐ Variabilă-Metrică cu memorie limitată deplasată, rangul 2
ld-var1 ‐ Variabilă-Metrică cu memorie limitată deplasată, rangul 1
ld-mma ‐ Metoda de mutare a asimptotelor
ld-lbfgs-nocedal - Nici unul
g-mlsl ‐ Conectare unică pe mai multe niveluri (necesită optimizare locală și
limite)
ld-lbfgs ‐ BFGS cu stocare redusă
gn-direct-l ‐ Împărțirea dreptunghiurilor (părtinitoare local)
ln-bobyqa ‐ Optimizare limitată de legaturi fără derivate
ln-sbplx ‐ Varianta subplex a lui Nelder-Mead
ln-newuoa-legat ‐ Optimizare fără derivate limitate de legături de
Aproximație cuadratică construită iterativ
auglag ‐ Algoritm lagrangian crescut
ln-praxis ‐ Optimizare locală fără gradient prin axa principală
Metodă
gn-direct-noscal ‐ Împărțirea dreptunghiurilor (nescalate)
ld-tnewton-precond-restart ‐ Newton trunchiat precondiționat cu
repornirea la cea mai abruptă coborâre
ld-slsqp ‐ Programare secvenţială pătratică cu cele mai mici pătrate

pas = 0; dubla în [0, inf)
Dimensiunea inițială a pasului pentru metodele fără gradient.

opri = -inf; dubla
Criteriu de oprire: valoarea funcției scade sub această valoare.

xtola = 0; dubla în [0, inf)
Criteriul de oprire: modificarea absolută a tuturor valorilor x este sub aceasta
valoare.

xtolr = 0; dubla în [0, inf)
Criteriul de oprire: modificarea relativă a tuturor valorilor x este sub aceasta
valoare.

EXEMPLU

Înregistrați imaginea test.v la imaginea ref.v utilizând o transformare spline cu un coeficient
cota de 5 si scrie imaginea inregistrata la reg.v. Utilizați două niveluri multirezoluție, ssd as
funcția de cost a imaginii și divcurl ponderate cu 10.0 ca penalizare a netezirii transformării.

mia-3dnonrigidreg -i test.v -r ref.v -o reg.v -l 2 -f spline:rate=3 imagine:cost=ssd
divcurl:weight=10

AUTOR(i)

Gert Wollny

DREPTURI DE AUTOR

Acest software este Copyright (c) 1999‐2015 Leipzig, Germania și Madrid, Spania. Este vorba
FĂRĂ ABSOLUT NU GARANȚIE și o puteți redistribui conform termenilor GNU
LICENȚĂ PUBLICĂ GENERALĂ Versiunea 3 (sau ulterioară). Pentru mai multe informații rulați programul cu
opțiunea „--copyright”.

Utilizați mia-3dnonrigidreg online folosind serviciile onworks.net